Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5Y3

Tppp2, Tubulin polymerization-promoting protein family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tppp2Q0P5Y3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tppp2Q0P5Y3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tppp2Q0P5Y3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tppp2Q0P5Y3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tppp2Q0P5Y3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tppp2Q0P5Y3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tppp2Q0P5Y3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tppp2Q0P5Y3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tppp2Q0P5Y3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tppp2Q0P5Y3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tppp2Q0P5Y3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tppp2Q0P5Y3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tppp2Q0P5Y3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tppp2Q0P5Y3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tppp2Q0P5Y3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tppp2Q0P5Y3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tppp2Q0P5Y3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tppp2Q0P5Y3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tppp2Q0P5Y3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tppp2Q0P5Y3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tppp2Q0P5Y3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tppp2Q0P5Y3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tppp2Q0P5Y3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tppp2Q0P5Y3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tppp2Q0P5Y3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tppp2Q0P5Y3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tppp2Q0P5Y3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tppp2Q0P5Y3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tppp2Q0P5Y3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tppp2Q0P5Y3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tppp2Q0P5Y3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tppp2Q0P5Y3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tppp2Q0P5Y3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tppp2Q0P5Y3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tppp2Q0P5Y3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tppp2Q0P5Y3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tppp2Q0P5Y3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tppp2Q0P5Y3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tppp2Q0P5Y3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tppp2Q0P5Y3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tppp2Q0P5Y3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tppp2Q0P5Y3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tppp2Q0P5Y3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tppp2Q0P5Y3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tppp2Q0P5Y3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tppp2Q0P5Y3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tppp2Q0P5Y3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tppp2Q0P5Y3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tppp2Q0P5Y3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tppp2Q0P5Y3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tppp2Q0P5Y3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tppp2Q0P5Y3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tppp2Q0P5Y3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tppp2Q0P5Y3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tppp2Q0P5Y3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tppp2Q0P5Y3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tppp2Q0P5Y3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tppp2Q0P5Y3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tppp2Q0P5Y3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tppp2Q0P5Y3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tppp2Q0P5Y3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tppp2Q0P5Y3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tppp2Q0P5Y3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tppp2Q0P5Y3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tppp2Q0P5Y3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tppp2Q0P5Y3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tppp2Q0P5Y3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tppp2Q0P5Y3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tppp2Q0P5Y3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tppp2Q0P5Y3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tppp2Q0P5Y3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tppp2Q0P5Y3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tppp2Q0P5Y3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tppp2Q0P5Y3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tppp2Q0P5Y3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tppp2Q0P5Y3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tppp2Q0P5Y3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tppp2Q0P5Y3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tppp2Q0P5Y3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tppp2Q0P5Y3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tppp2Q0P5Y3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tppp2Q0P5Y3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tppp2Q0P5Y3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tppp2Q0P5Y3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tppp2Q0P5Y3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tppp2Q0P5Y3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tppp2Q0P5Y3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tppp2Q0P5Y3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tppp2Q0P5Y3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tppp2Q0P5Y3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tppp2Q0P5Y3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tppp2Q0P5Y3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tppp2Q0P5Y3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tppp2Q0P5Y3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tppp2Q0P5Y3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tppp2Q0P5Y3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tppp2Q0P5Y3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tppp2Q0P5Y3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tppp2Q0P5Y3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tppp2Q0P5Y3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms