Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gcnt1Q09324 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gcnt1Q09324 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gcnt1Q09324 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gcnt1Q09324 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gcnt1Q09324 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gcnt1Q09324 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gcnt1Q09324 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gcnt1Q09324 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gcnt1Q09324 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Gcnt1Q09324 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gcnt1Q09324 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gcnt1Q09324 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gcnt1Q09324 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gcnt1Q09324 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gcnt1Q09324 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gcnt1Q09324 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gcnt1Q09324 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gcnt1Q09324 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gcnt1Q09324 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Gcnt1Q09324 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gcnt1Q09324 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Gcnt1Q09324 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gcnt1Q09324 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gcnt1Q09324 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gcnt1Q09324 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gcnt1Q09324 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gcnt1Q09324 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gcnt1Q09324 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gcnt1Q09324 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gcnt1Q09324 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gcnt1Q09324 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gcnt1Q09324 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gcnt1Q09324 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gcnt1Q09324 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gcnt1Q09324 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gcnt1Q09324 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Gcnt1Q09324 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gcnt1Q09324 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gcnt1Q09324 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gcnt1Q09324 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gcnt1Q09324 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gcnt1Q09324 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gcnt1Q09324 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gcnt1Q09324 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gcnt1Q09324 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Gcnt1Q09324 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gcnt1Q09324 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gcnt1Q09324 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gcnt1Q09324 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gcnt1Q09324 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gcnt1Q09324 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gcnt1Q09324 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gcnt1Q09324 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gcnt1Q09324 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Gcnt1Q09324 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gcnt1Q09324 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gcnt1Q09324 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gcnt1Q09324 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gcnt1Q09324 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gcnt1Q09324 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gcnt1Q09324 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gcnt1Q09324 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gcnt1Q09324 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gcnt1Q09324 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gcnt1Q09324 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gcnt1Q09324 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gcnt1Q09324 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gcnt1Q09324 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gcnt1Q09324 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gcnt1Q09324 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gcnt1Q09324 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Gcnt1Q09324 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gcnt1Q09324 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gcnt1Q09324 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gcnt1Q09324 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gcnt1Q09324 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gcnt1Q09324 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gcnt1Q09324 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gcnt1Q09324 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gcnt1Q09324 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gcnt1Q09324 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gcnt1Q09324 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gcnt1Q09324 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gcnt1Q09324 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gcnt1Q09324 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gcnt1Q09324 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gcnt1Q09324 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gcnt1Q09324 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gcnt1Q09324 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Gcnt1Q09324 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gcnt1Q09324 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gcnt1Q09324 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gcnt1Q09324 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gcnt1Q09324 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gcnt1Q09324 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gcnt1Q09324 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gcnt1Q09324 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gcnt1Q09324 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gcnt1Q09324 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms