Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tgm3Q08189 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tgm3Q08189 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tgm3Q08189 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tgm3Q08189 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tgm3Q08189 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tgm3Q08189 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tgm3Q08189 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tgm3Q08189 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Tgm3Q08189 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tgm3Q08189 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tgm3Q08189 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tgm3Q08189 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tgm3Q08189 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tgm3Q08189 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tgm3Q08189 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tgm3Q08189 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tgm3Q08189 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tgm3Q08189 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tgm3Q08189 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tgm3Q08189 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tgm3Q08189 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tgm3Q08189 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tgm3Q08189 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tgm3Q08189 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tgm3Q08189 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tgm3Q08189 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tgm3Q08189 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tgm3Q08189 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tgm3Q08189 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tgm3Q08189 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tgm3Q08189 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tgm3Q08189 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tgm3Q08189 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tgm3Q08189 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tgm3Q08189 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tgm3Q08189 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tgm3Q08189 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tgm3Q08189 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tgm3Q08189 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tgm3Q08189 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tgm3Q08189 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tgm3Q08189 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tgm3Q08189 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tgm3Q08189 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tgm3Q08189 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tgm3Q08189 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tgm3Q08189 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tgm3Q08189 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tgm3Q08189 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tgm3Q08189 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tgm3Q08189 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tgm3Q08189 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tgm3Q08189 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tgm3Q08189 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tgm3Q08189 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tgm3Q08189 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tgm3Q08189 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tgm3Q08189 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tgm3Q08189 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tgm3Q08189 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tgm3Q08189 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tgm3Q08189 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tgm3Q08189 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tgm3Q08189 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tgm3Q08189 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tgm3Q08189 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tgm3Q08189 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tgm3Q08189 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tgm3Q08189 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tgm3Q08189 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tgm3Q08189 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tgm3Q08189 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tgm3Q08189 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tgm3Q08189 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tgm3Q08189 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tgm3Q08189 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tgm3Q08189 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tgm3Q08189 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tgm3Q08189 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tgm3Q08189 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tgm3Q08189 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tgm3Q08189 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tgm3Q08189 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tgm3Q08189 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tgm3Q08189 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tgm3Q08189 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tgm3Q08189 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tgm3Q08189 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tgm3Q08189 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tgm3Q08189 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tgm3Q08189 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tgm3Q08189 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tgm3Q08189 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tgm3Q08189 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tgm3Q08189 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tgm3Q08189 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tgm3Q08189 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tgm3Q08189 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tgm3Q08189 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms