Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Scg2Q03517 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Scg2Q03517 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Scg2Q03517 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Scg2Q03517 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Scg2Q03517 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Scg2Q03517 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Scg2Q03517 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Scg2Q03517 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Scg2Q03517 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Scg2Q03517 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Scg2Q03517 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Scg2Q03517 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Scg2Q03517 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Scg2Q03517 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Scg2Q03517 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Scg2Q03517 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Scg2Q03517 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Scg2Q03517 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Scg2Q03517 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Scg2Q03517 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Scg2Q03517 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Scg2Q03517 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Scg2Q03517 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Scg2Q03517 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Scg2Q03517 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Scg2Q03517 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Scg2Q03517 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Scg2Q03517 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Scg2Q03517 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Scg2Q03517 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Scg2Q03517 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Scg2Q03517 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Scg2Q03517 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Scg2Q03517 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Scg2Q03517 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Scg2Q03517 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Scg2Q03517 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Scg2Q03517 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Scg2Q03517 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Scg2Q03517 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Scg2Q03517 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Scg2Q03517 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Scg2Q03517 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Scg2Q03517 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Scg2Q03517 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Scg2Q03517 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Scg2Q03517 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Scg2Q03517 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Scg2Q03517 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Scg2Q03517 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Scg2Q03517 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Scg2Q03517 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Scg2Q03517 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Scg2Q03517 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Scg2Q03517 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Scg2Q03517 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Scg2Q03517 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Scg2Q03517 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Scg2Q03517 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Scg2Q03517 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Scg2Q03517 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Scg2Q03517 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Scg2Q03517 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Scg2Q03517 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Scg2Q03517 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Scg2Q03517 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Scg2Q03517 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Scg2Q03517 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Scg2Q03517 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Scg2Q03517 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Scg2Q03517 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Scg2Q03517 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Scg2Q03517 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Scg2Q03517 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Scg2Q03517 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Scg2Q03517 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Scg2Q03517 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Scg2Q03517 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Scg2Q03517 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Scg2Q03517 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Scg2Q03517 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Scg2Q03517 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Scg2Q03517 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Scg2Q03517 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Scg2Q03517 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Scg2Q03517 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Scg2Q03517 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Scg2Q03517 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Scg2Q03517 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Scg2Q03517 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Scg2Q03517 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Scg2Q03517 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Scg2Q03517 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Scg2Q03517 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Scg2Q03517 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Scg2Q03517 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Scg2Q03517 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Scg2Q03517 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Scg2Q03517 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms