Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Serpina1cQ00896 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Serpina1cQ00896 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Serpina1cQ00896 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Serpina1cQ00896 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Serpina1cQ00896 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Serpina1cQ00896 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Serpina1cQ00896 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Serpina1cQ00896 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Serpina1cQ00896 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Serpina1cQ00896 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Serpina1cQ00896 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Serpina1cQ00896 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Serpina1cQ00896 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Serpina1cQ00896 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Serpina1cQ00896 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Serpina1cQ00896 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Serpina1cQ00896 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Serpina1cQ00896 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Serpina1cQ00896 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Serpina1cQ00896 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Serpina1cQ00896 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Serpina1cQ00896 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Serpina1cQ00896 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Serpina1cQ00896 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Serpina1cQ00896 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Serpina1cQ00896 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Serpina1cQ00896 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Serpina1cQ00896 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Serpina1cQ00896 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Serpina1cQ00896 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Serpina1cQ00896 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Serpina1cQ00896 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Serpina1cQ00896 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Serpina1cQ00896 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Serpina1cQ00896 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Serpina1cQ00896 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Serpina1cQ00896 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Serpina1cQ00896 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Serpina1cQ00896 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Serpina1cQ00896 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Serpina1cQ00896 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Serpina1cQ00896 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Serpina1cQ00896 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Serpina1cQ00896 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Serpina1cQ00896 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Serpina1cQ00896 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Serpina1cQ00896 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Serpina1cQ00896 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Serpina1cQ00896 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Serpina1cQ00896 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Serpina1cQ00896 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Serpina1cQ00896 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Serpina1cQ00896 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Serpina1cQ00896 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Serpina1cQ00896 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Serpina1cQ00896 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Serpina1cQ00896 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Serpina1cQ00896 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Serpina1cQ00896 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Serpina1cQ00896 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Serpina1cQ00896 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Serpina1cQ00896 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Serpina1cQ00896 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Serpina1cQ00896 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Serpina1cQ00896 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Serpina1cQ00896 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Serpina1cQ00896 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Serpina1cQ00896 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Serpina1cQ00896 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Serpina1cQ00896 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Serpina1cQ00896 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Serpina1cQ00896 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Serpina1cQ00896 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Serpina1cQ00896 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Serpina1cQ00896 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Serpina1cQ00896 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Serpina1cQ00896 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Serpina1cQ00896 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Serpina1cQ00896 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Serpina1cQ00896 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Serpina1cQ00896 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Serpina1cQ00896 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Serpina1cQ00896 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Serpina1cQ00896 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Serpina1cQ00896 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Serpina1cQ00896 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Serpina1cQ00896 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Serpina1cQ00896 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Serpina1cQ00896 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Serpina1cQ00896 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Serpina1cQ00896 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Serpina1cQ00896 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Serpina1cQ00896 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Serpina1cQ00896 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Serpina1cQ00896 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Serpina1cQ00896 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Serpina1cQ00896 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Serpina1cQ00896 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Serpina1cQ00896 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms