Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Apba2P98084 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Apba2P98084 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Apba2P98084 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Apba2P98084 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Apba2P98084 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Apba2P98084 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Apba2P98084 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Apba2P98084 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Apba2P98084 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Apba2P98084 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Apba2P98084 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Apba2P98084 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Apba2P98084 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Apba2P98084 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Apba2P98084 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Apba2P98084 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Apba2P98084 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Apba2P98084 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Apba2P98084 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Apba2P98084 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Apba2P98084 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Apba2P98084 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Apba2P98084 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Apba2P98084 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Apba2P98084 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Apba2P98084 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Apba2P98084 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Apba2P98084 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Apba2P98084 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Apba2P98084 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Apba2P98084 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Apba2P98084 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Apba2P98084 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Apba2P98084 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Apba2P98084 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Apba2P98084 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Apba2P98084 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Apba2P98084 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Apba2P98084 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Apba2P98084 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Apba2P98084 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Apba2P98084 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Apba2P98084 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Apba2P98084 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Apba2P98084 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Apba2P98084 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Apba2P98084 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Apba2P98084 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Apba2P98084 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Apba2P98084 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Apba2P98084 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Apba2P98084 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Apba2P98084 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Apba2P98084 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Apba2P98084 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Apba2P98084 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Apba2P98084 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Apba2P98084 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Apba2P98084 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Apba2P98084 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Apba2P98084 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Apba2P98084 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Apba2P98084 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Apba2P98084 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Apba2P98084 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Apba2P98084 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Apba2P98084 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Apba2P98084 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Apba2P98084 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Apba2P98084 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Apba2P98084 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Apba2P98084 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Apba2P98084 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Apba2P98084 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Apba2P98084 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Apba2P98084 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Apba2P98084 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Apba2P98084 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Apba2P98084 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Apba2P98084 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Apba2P98084 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Apba2P98084 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Apba2P98084 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Apba2P98084 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Apba2P98084 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Apba2P98084 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Apba2P98084 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Apba2P98084 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Apba2P98084 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Apba2P98084 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Apba2P98084 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Apba2P98084 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Apba2P98084 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Apba2P98084 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Apba2P98084 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Apba2P98084 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Apba2P98084 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Apba2P98084 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Apba2P98084 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.5 ms