Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npas1P97459 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Npas1P97459 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Npas1P97459 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npas1P97459 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Npas1P97459 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Npas1P97459 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Npas1P97459 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Npas1P97459 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Npas1P97459 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npas1P97459 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npas1P97459 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npas1P97459 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npas1P97459 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npas1P97459 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npas1P97459 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npas1P97459 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npas1P97459 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npas1P97459 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npas1P97459 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npas1P97459 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Npas1P97459 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npas1P97459 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npas1P97459 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Npas1P97459 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Npas1P97459 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Npas1P97459 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npas1P97459 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npas1P97459 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npas1P97459 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Npas1P97459 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Npas1P97459 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Npas1P97459 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npas1P97459 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Npas1P97459 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npas1P97459 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Npas1P97459 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npas1P97459 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npas1P97459 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npas1P97459 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npas1P97459 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas1P97459 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas1P97459 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Npas1P97459 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas1P97459 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Npas1P97459 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Npas1P97459 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Npas1P97459 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas1P97459 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas1P97459 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Npas1P97459 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Npas1P97459 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Npas1P97459 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Npas1P97459 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Npas1P97459 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Npas1P97459 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Npas1P97459 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Npas1P97459 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Npas1P97459 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Npas1P97459 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npas1P97459 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npas1P97459 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Npas1P97459 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Npas1P97459 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Npas1P97459 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Npas1P97459 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Npas1P97459 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Npas1P97459 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Npas1P97459 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Npas1P97459 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Npas1P97459 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Npas1P97459 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Npas1P97459 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas1P97459 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas1P97459 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas1P97459 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas1P97459 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas1P97459 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Npas1P97459 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Npas1P97459 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Npas1P97459 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Npas1P97459 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Npas1P97459 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas1P97459 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas1P97459 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas1P97459 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas1P97459 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Npas1P97459 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Npas1P97459 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Npas1P97459 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Npas1P97459 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Npas1P97459 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Npas1P97459 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Npas1P97459 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Npas1P97459 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Npas1P97459 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Npas1P97459 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Npas1P97459 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Npas1P97459 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Npas1P97459 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms