Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mesp1P97309 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mesp1P97309 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mesp1P97309 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mesp1P97309 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mesp1P97309 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mesp1P97309 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mesp1P97309 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mesp1P97309 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mesp1P97309 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mesp1P97309 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mesp1P97309 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mesp1P97309 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mesp1P97309 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mesp1P97309 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mesp1P97309 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mesp1P97309 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mesp1P97309 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mesp1P97309 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mesp1P97309 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mesp1P97309 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mesp1P97309 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mesp1P97309 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mesp1P97309 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mesp1P97309 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mesp1P97309 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mesp1P97309 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mesp1P97309 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mesp1P97309 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mesp1P97309 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mesp1P97309 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mesp1P97309 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mesp1P97309 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mesp1P97309 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mesp1P97309 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mesp1P97309 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mesp1P97309 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mesp1P97309 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mesp1P97309 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mesp1P97309 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mesp1P97309 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mesp1P97309 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mesp1P97309 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mesp1P97309 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mesp1P97309 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mesp1P97309 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mesp1P97309 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mesp1P97309 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mesp1P97309 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mesp1P97309 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mesp1P97309 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mesp1P97309 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mesp1P97309 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mesp1P97309 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mesp1P97309 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mesp1P97309 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mesp1P97309 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mesp1P97309 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mesp1P97309 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mesp1P97309 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mesp1P97309 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mesp1P97309 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mesp1P97309 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mesp1P97309 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mesp1P97309 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mesp1P97309 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mesp1P97309 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mesp1P97309 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mesp1P97309 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mesp1P97309 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mesp1P97309 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mesp1P97309 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mesp1P97309 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mesp1P97309 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mesp1P97309 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mesp1P97309 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mesp1P97309 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mesp1P97309 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mesp1P97309 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mesp1P97309 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mesp1P97309 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mesp1P97309 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mesp1P97309 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mesp1P97309 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mesp1P97309 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mesp1P97309 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mesp1P97309 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mesp1P97309 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mesp1P97309 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mesp1P97309 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mesp1P97309 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mesp1P97309 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mesp1P97309 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mesp1P97309 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mesp1P97309 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mesp1P97309 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mesp1P97309 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mesp1P97309 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mesp1P97309 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mesp1P97309 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms