Protein–RNA interactions for Protein: P97291

Cdh8, Cadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh8P97291 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdh8P97291 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdh8P97291 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdh8P97291 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdh8P97291 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdh8P97291 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdh8P97291 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdh8P97291 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdh8P97291 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdh8P97291 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdh8P97291 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdh8P97291 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdh8P97291 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdh8P97291 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdh8P97291 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdh8P97291 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdh8P97291 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdh8P97291 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdh8P97291 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdh8P97291 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdh8P97291 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdh8P97291 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdh8P97291 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdh8P97291 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdh8P97291 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdh8P97291 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdh8P97291 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdh8P97291 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdh8P97291 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdh8P97291 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdh8P97291 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdh8P97291 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdh8P97291 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdh8P97291 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdh8P97291 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdh8P97291 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdh8P97291 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdh8P97291 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdh8P97291 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdh8P97291 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdh8P97291 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdh8P97291 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdh8P97291 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdh8P97291 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdh8P97291 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdh8P97291 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdh8P97291 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdh8P97291 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdh8P97291 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdh8P97291 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdh8P97291 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdh8P97291 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdh8P97291 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdh8P97291 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdh8P97291 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdh8P97291 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdh8P97291 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdh8P97291 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdh8P97291 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdh8P97291 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdh8P97291 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdh8P97291 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdh8P97291 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdh8P97291 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdh8P97291 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdh8P97291 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdh8P97291 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdh8P97291 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdh8P97291 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdh8P97291 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdh8P97291 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdh8P97291 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdh8P97291 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdh8P97291 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdh8P97291 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdh8P97291 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdh8P97291 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdh8P97291 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdh8P97291 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdh8P97291 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdh8P97291 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdh8P97291 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdh8P97291 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cdh8P97291 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cdh8P97291 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cdh8P97291 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdh8P97291 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdh8P97291 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdh8P97291 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdh8P97291 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdh8P97291 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdh8P97291 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdh8P97291 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdh8P97291 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdh8P97291 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdh8P97291 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdh8P97291 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdh8P97291 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdh8P97291 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdh8P97291 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms