Protein–RNA interactions for Protein: P86050

Tmem170b, Transmembrane protein 170B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem170bP86050 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem170bP86050 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem170bP86050 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem170bP86050 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem170bP86050 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem170bP86050 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem170bP86050 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem170bP86050 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem170bP86050 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem170bP86050 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem170bP86050 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem170bP86050 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem170bP86050 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem170bP86050 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem170bP86050 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem170bP86050 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem170bP86050 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem170bP86050 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem170bP86050 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem170bP86050 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem170bP86050 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem170bP86050 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem170bP86050 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem170bP86050 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem170bP86050 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem170bP86050 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem170bP86050 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem170bP86050 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem170bP86050 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem170bP86050 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem170bP86050 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem170bP86050 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem170bP86050 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem170bP86050 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem170bP86050 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem170bP86050 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem170bP86050 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem170bP86050 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem170bP86050 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem170bP86050 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem170bP86050 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem170bP86050 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem170bP86050 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem170bP86050 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem170bP86050 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem170bP86050 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem170bP86050 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem170bP86050 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem170bP86050 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem170bP86050 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem170bP86050 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem170bP86050 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem170bP86050 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem170bP86050 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem170bP86050 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem170bP86050 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem170bP86050 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem170bP86050 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem170bP86050 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem170bP86050 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem170bP86050 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem170bP86050 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem170bP86050 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem170bP86050 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem170bP86050 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem170bP86050 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem170bP86050 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem170bP86050 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem170bP86050 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem170bP86050 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem170bP86050 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem170bP86050 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem170bP86050 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem170bP86050 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem170bP86050 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem170bP86050 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem170bP86050 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem170bP86050 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem170bP86050 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem170bP86050 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem170bP86050 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem170bP86050 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem170bP86050 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms