Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irx1P81068 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irx1P81068 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irx1P81068 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irx1P81068 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irx1P81068 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irx1P81068 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irx1P81068 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx1P81068 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irx1P81068 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Irx1P81068 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Irx1P81068 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx1P81068 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx1P81068 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx1P81068 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irx1P81068 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx1P81068 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx1P81068 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx1P81068 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irx1P81068 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irx1P81068 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Irx1P81068 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irx1P81068 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irx1P81068 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx1P81068 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx1P81068 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx1P81068 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irx1P81068 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irx1P81068 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Irx1P81068 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx1P81068 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx1P81068 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx1P81068 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx1P81068 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx1P81068 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx1P81068 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx1P81068 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx1P81068 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx1P81068 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irx1P81068 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Irx1P81068 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Irx1P81068 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx1P81068 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx1P81068 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irx1P81068 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irx1P81068 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx1P81068 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx1P81068 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx1P81068 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx1P81068 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irx1P81068 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irx1P81068 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irx1P81068 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx1P81068 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx1P81068 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx1P81068 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx1P81068 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx1P81068 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irx1P81068 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irx1P81068 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irx1P81068 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Irx1P81068 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irx1P81068 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irx1P81068 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Irx1P81068 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irx1P81068 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irx1P81068 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irx1P81068 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Irx1P81068 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Irx1P81068 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irx1P81068 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irx1P81068 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irx1P81068 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irx1P81068 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irx1P81068 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irx1P81068 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irx1P81068 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irx1P81068 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irx1P81068 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx1P81068 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx1P81068 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx1P81068 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx1P81068 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx1P81068 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx1P81068 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx1P81068 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx1P81068 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx1P81068 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx1P81068 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx1P81068 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx1P81068 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx1P81068 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx1P81068 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Irx1P81068 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx1P81068 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx1P81068 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irx1P81068 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx1P81068 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx1P81068 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx1P81068 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms