Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubb4bP68372 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tubb4bP68372 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubb4bP68372 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tubb4bP68372 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tubb4bP68372 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tubb4bP68372 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tubb4bP68372 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tubb4bP68372 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tubb4bP68372 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tubb4bP68372 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tubb4bP68372 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tubb4bP68372 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tubb4bP68372 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tubb4bP68372 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tubb4bP68372 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tubb4bP68372 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tubb4bP68372 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tubb4bP68372 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tubb4bP68372 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tubb4bP68372 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Tubb4bP68372 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tubb4bP68372 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tubb4bP68372 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tubb4bP68372 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tubb4bP68372 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tubb4bP68372 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubb4bP68372 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubb4bP68372 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tubb4bP68372 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tubb4bP68372 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubb4bP68372 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubb4bP68372 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubb4bP68372 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubb4bP68372 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubb4bP68372 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubb4bP68372 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubb4bP68372 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tubb4bP68372 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tubb4bP68372 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tubb4bP68372 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubb4bP68372 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubb4bP68372 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubb4bP68372 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tubb4bP68372 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tubb4bP68372 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tubb4bP68372 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tubb4bP68372 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tubb4bP68372 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubb4bP68372 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubb4bP68372 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tubb4bP68372 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tubb4bP68372 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tubb4bP68372 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tubb4bP68372 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tubb4bP68372 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tubb4bP68372 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb4bP68372 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb4bP68372 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubb4bP68372 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubb4bP68372 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubb4bP68372 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubb4bP68372 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubb4bP68372 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubb4bP68372 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubb4bP68372 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubb4bP68372 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tubb4bP68372 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tubb4bP68372 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubb4bP68372 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubb4bP68372 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubb4bP68372 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubb4bP68372 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tubb4bP68372 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tubb4bP68372 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tubb4bP68372 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubb4bP68372 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubb4bP68372 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubb4bP68372 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubb4bP68372 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubb4bP68372 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubb4bP68372 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubb4bP68372 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tubb4bP68372 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tubb4bP68372 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tubb4bP68372 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tubb4bP68372 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tubb4bP68372 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tubb4bP68372 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubb4bP68372 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubb4bP68372 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubb4bP68372 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubb4bP68372 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubb4bP68372 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubb4bP68372 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubb4bP68372 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubb4bP68372 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubb4bP68372 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubb4bP68372 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubb4bP68372 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms