Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp2P63044 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp2P63044 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp2P63044 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp2P63044 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp2P63044 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp2P63044 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp2P63044 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp2P63044 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp2P63044 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp2P63044 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vamp2P63044 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp2P63044 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp2P63044 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp2P63044 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp2P63044 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp2P63044 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vamp2P63044 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp2P63044 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp2P63044 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp2P63044 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp2P63044 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp2P63044 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp2P63044 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp2P63044 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vamp2P63044 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp2P63044 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp2P63044 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp2P63044 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp2P63044 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp2P63044 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp2P63044 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp2P63044 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp2P63044 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp2P63044 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp2P63044 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp2P63044 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp2P63044 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp2P63044 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp2P63044 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp2P63044 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp2P63044 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp2P63044 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp2P63044 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp2P63044 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp2P63044 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp2P63044 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp2P63044 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp2P63044 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp2P63044 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp2P63044 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp2P63044 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp2P63044 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp2P63044 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp2P63044 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp2P63044 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp2P63044 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp2P63044 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp2P63044 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp2P63044 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp2P63044 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp2P63044 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp2P63044 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vamp2P63044 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp2P63044 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp2P63044 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp2P63044 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms