Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PlnP61014 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PlnP61014 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PlnP61014 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PlnP61014 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PlnP61014 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PlnP61014 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PlnP61014 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PlnP61014 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PlnP61014 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PlnP61014 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PlnP61014 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PlnP61014 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PlnP61014 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PlnP61014 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PlnP61014 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PlnP61014 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PlnP61014 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PlnP61014 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PlnP61014 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PlnP61014 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PlnP61014 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PlnP61014 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PlnP61014 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PlnP61014 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PlnP61014 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PlnP61014 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PlnP61014 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PlnP61014 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PlnP61014 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PlnP61014 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PlnP61014 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PlnP61014 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PlnP61014 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PlnP61014 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PlnP61014 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PlnP61014 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PlnP61014 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PlnP61014 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PlnP61014 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PlnP61014 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PlnP61014 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PlnP61014 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PlnP61014 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PlnP61014 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PlnP61014 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PlnP61014 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PlnP61014 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PlnP61014 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PlnP61014 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PlnP61014 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PlnP61014 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PlnP61014 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PlnP61014 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PlnP61014 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PlnP61014 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PlnP61014 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PlnP61014 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PlnP61014 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PlnP61014 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PlnP61014 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PlnP61014 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PlnP61014 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PlnP61014 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PlnP61014 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PlnP61014 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PlnP61014 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PlnP61014 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PlnP61014 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PlnP61014 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PlnP61014 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PlnP61014 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PlnP61014 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PlnP61014 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PlnP61014 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PlnP61014 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PlnP61014 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PlnP61014 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PlnP61014 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PlnP61014 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PlnP61014 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PlnP61014 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PlnP61014 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PlnP61014 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PlnP61014 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PlnP61014 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PlnP61014 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PlnP61014 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PlnP61014 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PlnP61014 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PlnP61014 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PlnP61014 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PlnP61014 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PlnP61014 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PlnP61014 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PlnP61014 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PlnP61014 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PlnP61014 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PlnP61014 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PlnP61014 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms