Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Csrnp3P59055 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Csrnp3P59055 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Csrnp3P59055 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Csrnp3P59055 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Csrnp3P59055 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Csrnp3P59055 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Csrnp3P59055 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Csrnp3P59055 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Csrnp3P59055 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Csrnp3P59055 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Csrnp3P59055 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Csrnp3P59055 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Csrnp3P59055 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Csrnp3P59055 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Csrnp3P59055 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Csrnp3P59055 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Csrnp3P59055 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Csrnp3P59055 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Csrnp3P59055 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Csrnp3P59055 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Csrnp3P59055 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Csrnp3P59055 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Csrnp3P59055 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Csrnp3P59055 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Csrnp3P59055 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Csrnp3P59055 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Csrnp3P59055 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Csrnp3P59055 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Csrnp3P59055 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Csrnp3P59055 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Csrnp3P59055 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Csrnp3P59055 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Csrnp3P59055 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Csrnp3P59055 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Csrnp3P59055 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Csrnp3P59055 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Csrnp3P59055 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Csrnp3P59055 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Csrnp3P59055 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Csrnp3P59055 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Csrnp3P59055 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Csrnp3P59055 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Csrnp3P59055 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Csrnp3P59055 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Csrnp3P59055 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Csrnp3P59055 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Csrnp3P59055 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Csrnp3P59055 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Csrnp3P59055 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Csrnp3P59055 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Csrnp3P59055 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Csrnp3P59055 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Csrnp3P59055 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Csrnp3P59055 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Csrnp3P59055 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Csrnp3P59055 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Csrnp3P59055 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Csrnp3P59055 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Csrnp3P59055 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Csrnp3P59055 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Csrnp3P59055 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Csrnp3P59055 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Csrnp3P59055 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Csrnp3P59055 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Csrnp3P59055 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Csrnp3P59055 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Csrnp3P59055 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Csrnp3P59055 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Csrnp3P59055 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Csrnp3P59055 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Csrnp3P59055 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Csrnp3P59055 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Csrnp3P59055 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Csrnp3P59055 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Csrnp3P59055 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Csrnp3P59055 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Csrnp3P59055 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Csrnp3P59055 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Csrnp3P59055 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Csrnp3P59055 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Csrnp3P59055 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Csrnp3P59055 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Csrnp3P59055 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Csrnp3P59055 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Csrnp3P59055 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Csrnp3P59055 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Csrnp3P59055 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Csrnp3P59055 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Csrnp3P59055 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Csrnp3P59055 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Csrnp3P59055 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Csrnp3P59055 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Csrnp3P59055 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Csrnp3P59055 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Csrnp3P59055 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Csrnp3P59055 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Csrnp3P59055 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Csrnp3P59055 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Csrnp3P59055 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms