Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NcanP55066 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NcanP55066 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NcanP55066 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NcanP55066 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NcanP55066 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NcanP55066 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NcanP55066 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NcanP55066 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NcanP55066 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NcanP55066 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NcanP55066 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NcanP55066 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NcanP55066 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NcanP55066 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NcanP55066 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NcanP55066 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NcanP55066 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NcanP55066 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NcanP55066 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NcanP55066 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NcanP55066 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NcanP55066 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NcanP55066 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NcanP55066 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NcanP55066 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NcanP55066 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NcanP55066 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NcanP55066 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NcanP55066 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NcanP55066 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NcanP55066 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NcanP55066 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NcanP55066 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NcanP55066 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NcanP55066 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NcanP55066 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NcanP55066 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NcanP55066 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NcanP55066 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NcanP55066 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NcanP55066 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NcanP55066 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NcanP55066 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NcanP55066 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NcanP55066 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NcanP55066 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NcanP55066 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NcanP55066 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NcanP55066 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NcanP55066 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NcanP55066 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NcanP55066 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NcanP55066 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NcanP55066 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NcanP55066 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NcanP55066 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NcanP55066 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NcanP55066 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NcanP55066 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NcanP55066 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NcanP55066 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NcanP55066 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NcanP55066 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NcanP55066 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NcanP55066 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NcanP55066 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NcanP55066 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NcanP55066 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NcanP55066 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NcanP55066 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NcanP55066 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NcanP55066 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NcanP55066 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NcanP55066 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NcanP55066 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NcanP55066 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NcanP55066 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NcanP55066 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NcanP55066 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NcanP55066 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NcanP55066 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NcanP55066 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NcanP55066 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NcanP55066 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NcanP55066 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NcanP55066 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NcanP55066 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NcanP55066 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NcanP55066 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NcanP55066 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NcanP55066 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NcanP55066 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NcanP55066 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NcanP55066 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NcanP55066 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NcanP55066 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NcanP55066 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NcanP55066 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NcanP55066 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
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