Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RabggtbP53612 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RabggtbP53612 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RabggtbP53612 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RabggtbP53612 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RabggtbP53612 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RabggtbP53612 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RabggtbP53612 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RabggtbP53612 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RabggtbP53612 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RabggtbP53612 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RabggtbP53612 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RabggtbP53612 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RabggtbP53612 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RabggtbP53612 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RabggtbP53612 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RabggtbP53612 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RabggtbP53612 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RabggtbP53612 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RabggtbP53612 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RabggtbP53612 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RabggtbP53612 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RabggtbP53612 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RabggtbP53612 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RabggtbP53612 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RabggtbP53612 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RabggtbP53612 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RabggtbP53612 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RabggtbP53612 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RabggtbP53612 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RabggtbP53612 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RabggtbP53612 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RabggtbP53612 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RabggtbP53612 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RabggtbP53612 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RabggtbP53612 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RabggtbP53612 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RabggtbP53612 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RabggtbP53612 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RabggtbP53612 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RabggtbP53612 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RabggtbP53612 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RabggtbP53612 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RabggtbP53612 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RabggtbP53612 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RabggtbP53612 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RabggtbP53612 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RabggtbP53612 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RabggtbP53612 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RabggtbP53612 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RabggtbP53612 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RabggtbP53612 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RabggtbP53612 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RabggtbP53612 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RabggtbP53612 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RabggtbP53612 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RabggtbP53612 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RabggtbP53612 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RabggtbP53612 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RabggtbP53612 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RabggtbP53612 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RabggtbP53612 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RabggtbP53612 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RabggtbP53612 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RabggtbP53612 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RabggtbP53612 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RabggtbP53612 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RabggtbP53612 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RabggtbP53612 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RabggtbP53612 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RabggtbP53612 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RabggtbP53612 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RabggtbP53612 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RabggtbP53612 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RabggtbP53612 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RabggtbP53612 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RabggtbP53612 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RabggtbP53612 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RabggtbP53612 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RabggtbP53612 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RabggtbP53612 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RabggtbP53612 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RabggtbP53612 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RabggtbP53612 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RabggtbP53612 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RabggtbP53612 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RabggtbP53612 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RabggtbP53612 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RabggtbP53612 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RabggtbP53612 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RabggtbP53612 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RabggtbP53612 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RabggtbP53612 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RabggtbP53612 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RabggtbP53612 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RabggtbP53612 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RabggtbP53612 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RabggtbP53612 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RabggtbP53612 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RabggtbP53612 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms