Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CastP51125 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CastP51125 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CastP51125 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CastP51125 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CastP51125 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CastP51125 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CastP51125 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CastP51125 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CastP51125 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CastP51125 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CastP51125 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CastP51125 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CastP51125 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CastP51125 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CastP51125 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CastP51125 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CastP51125 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CastP51125 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CastP51125 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CastP51125 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CastP51125 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CastP51125 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CastP51125 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CastP51125 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CastP51125 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CastP51125 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CastP51125 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CastP51125 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CastP51125 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CastP51125 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CastP51125 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
CastP51125 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CastP51125 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CastP51125 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
CastP51125 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CastP51125 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CastP51125 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CastP51125 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CastP51125 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CastP51125 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CastP51125 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CastP51125 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CastP51125 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CastP51125 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CastP51125 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CastP51125 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CastP51125 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CastP51125 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CastP51125 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CastP51125 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CastP51125 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CastP51125 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CastP51125 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CastP51125 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CastP51125 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CastP51125 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CastP51125 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CastP51125 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CastP51125 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CastP51125 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CastP51125 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CastP51125 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CastP51125 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CastP51125 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CastP51125 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CastP51125 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CastP51125 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CastP51125 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CastP51125 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CastP51125 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CastP51125 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CastP51125 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CastP51125 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CastP51125 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CastP51125 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CastP51125 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CastP51125 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CastP51125 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CastP51125 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CastP51125 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CastP51125 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CastP51125 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CastP51125 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CastP51125 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CastP51125 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CastP51125 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CastP51125 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CastP51125 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CastP51125 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CastP51125 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CastP51125 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CastP51125 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CastP51125 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CastP51125 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CastP51125 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CastP51125 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CastP51125 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CastP51125 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CastP51125 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms