Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ercc3P49135 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ercc3P49135 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ercc3P49135 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ercc3P49135 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ercc3P49135 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ercc3P49135 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ercc3P49135 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ercc3P49135 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ercc3P49135 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ercc3P49135 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ercc3P49135 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ercc3P49135 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ercc3P49135 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ercc3P49135 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ercc3P49135 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ercc3P49135 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Ercc3P49135 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ercc3P49135 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ercc3P49135 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ercc3P49135 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Ercc3P49135 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ercc3P49135 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ercc3P49135 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Ercc3P49135 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ercc3P49135 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ercc3P49135 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ercc3P49135 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ercc3P49135 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ercc3P49135 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ercc3P49135 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ercc3P49135 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ercc3P49135 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ercc3P49135 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ercc3P49135 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ercc3P49135 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ercc3P49135 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ercc3P49135 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ercc3P49135 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ercc3P49135 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ercc3P49135 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ercc3P49135 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ercc3P49135 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ercc3P49135 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ercc3P49135 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Ercc3P49135 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ercc3P49135 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ercc3P49135 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ercc3P49135 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ercc3P49135 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ercc3P49135 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ercc3P49135 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ercc3P49135 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ercc3P49135 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ercc3P49135 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ercc3P49135 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ercc3P49135 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Ercc3P49135 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ercc3P49135 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ercc3P49135 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ercc3P49135 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ercc3P49135 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ercc3P49135 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ercc3P49135 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ercc3P49135 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ercc3P49135 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ercc3P49135 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ercc3P49135 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ercc3P49135 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ercc3P49135 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ercc3P49135 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ercc3P49135 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ercc3P49135 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ercc3P49135 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ercc3P49135 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ercc3P49135 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ercc3P49135 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ercc3P49135 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ercc3P49135 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ercc3P49135 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ercc3P49135 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ercc3P49135 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Ercc3P49135 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ercc3P49135 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ercc3P49135 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ercc3P49135 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ercc3P49135 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ercc3P49135 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ercc3P49135 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ercc3P49135 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ercc3P49135 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ercc3P49135 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ercc3P49135 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ercc3P49135 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ercc3P49135 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ercc3P49135 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ercc3P49135 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ercc3P49135 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ercc3P49135 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ercc3P49135 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms