Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptx3P48759 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptx3P48759 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptx3P48759 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptx3P48759 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptx3P48759 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptx3P48759 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptx3P48759 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptx3P48759 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptx3P48759 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptx3P48759 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptx3P48759 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptx3P48759 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptx3P48759 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptx3P48759 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptx3P48759 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptx3P48759 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptx3P48759 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptx3P48759 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptx3P48759 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptx3P48759 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptx3P48759 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptx3P48759 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptx3P48759 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptx3P48759 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptx3P48759 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptx3P48759 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptx3P48759 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptx3P48759 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptx3P48759 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptx3P48759 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptx3P48759 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptx3P48759 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptx3P48759 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptx3P48759 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptx3P48759 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptx3P48759 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptx3P48759 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptx3P48759 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptx3P48759 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptx3P48759 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptx3P48759 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptx3P48759 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptx3P48759 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptx3P48759 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptx3P48759 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptx3P48759 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptx3P48759 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptx3P48759 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptx3P48759 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptx3P48759 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptx3P48759 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptx3P48759 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptx3P48759 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptx3P48759 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptx3P48759 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptx3P48759 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptx3P48759 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ptx3P48759 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptx3P48759 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptx3P48759 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptx3P48759 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptx3P48759 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptx3P48759 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptx3P48759 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptx3P48759 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptx3P48759 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptx3P48759 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptx3P48759 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptx3P48759 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptx3P48759 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptx3P48759 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptx3P48759 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptx3P48759 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptx3P48759 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptx3P48759 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptx3P48759 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptx3P48759 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptx3P48759 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptx3P48759 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptx3P48759 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptx3P48759 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptx3P48759 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptx3P48759 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptx3P48759 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptx3P48759 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptx3P48759 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ptx3P48759 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptx3P48759 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptx3P48759 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptx3P48759 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptx3P48759 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptx3P48759 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptx3P48759 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptx3P48759 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptx3P48759 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptx3P48759 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptx3P48759 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptx3P48759 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptx3P48759 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms