Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccl11P48298 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl11P48298 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl11P48298 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl11P48298 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl11P48298 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl11P48298 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl11P48298 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl11P48298 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl11P48298 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl11P48298 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl11P48298 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl11P48298 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl11P48298 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl11P48298 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl11P48298 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl11P48298 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccl11P48298 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl11P48298 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl11P48298 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl11P48298 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccl11P48298 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccl11P48298 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl11P48298 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl11P48298 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl11P48298 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl11P48298 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl11P48298 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl11P48298 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl11P48298 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl11P48298 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccl11P48298 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl11P48298 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccl11P48298 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccl11P48298 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccl11P48298 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccl11P48298 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccl11P48298 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccl11P48298 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccl11P48298 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccl11P48298 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccl11P48298 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccl11P48298 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccl11P48298 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccl11P48298 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccl11P48298 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccl11P48298 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl11P48298 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl11P48298 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl11P48298 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccl11P48298 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccl11P48298 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccl11P48298 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccl11P48298 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccl11P48298 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccl11P48298 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccl11P48298 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccl11P48298 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccl11P48298 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccl11P48298 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccl11P48298 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccl11P48298 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccl11P48298 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccl11P48298 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccl11P48298 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccl11P48298 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccl11P48298 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccl11P48298 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccl11P48298 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccl11P48298 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccl11P48298 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccl11P48298 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccl11P48298 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccl11P48298 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccl11P48298 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccl11P48298 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccl11P48298 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccl11P48298 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccl11P48298 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccl11P48298 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccl11P48298 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccl11P48298 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccl11P48298 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccl11P48298 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccl11P48298 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccl11P48298 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccl11P48298 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccl11P48298 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccl11P48298 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccl11P48298 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccl11P48298 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccl11P48298 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccl11P48298 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccl11P48298 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccl11P48298 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccl11P48298 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccl11P48298 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccl11P48298 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccl11P48298 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccl11P48298 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms