Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igfbp3P47878 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igfbp3P47878 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igfbp3P47878 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igfbp3P47878 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igfbp3P47878 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igfbp3P47878 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igfbp3P47878 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igfbp3P47878 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igfbp3P47878 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igfbp3P47878 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igfbp3P47878 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igfbp3P47878 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igfbp3P47878 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igfbp3P47878 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Igfbp3P47878 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igfbp3P47878 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igfbp3P47878 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igfbp3P47878 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Igfbp3P47878 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igfbp3P47878 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Igfbp3P47878 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Igfbp3P47878 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igfbp3P47878 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igfbp3P47878 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igfbp3P47878 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igfbp3P47878 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igfbp3P47878 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Igfbp3P47878 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Igfbp3P47878 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Igfbp3P47878 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Igfbp3P47878 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Igfbp3P47878 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Igfbp3P47878 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Igfbp3P47878 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Igfbp3P47878 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Igfbp3P47878 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Igfbp3P47878 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igfbp3P47878 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igfbp3P47878 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Igfbp3P47878 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Igfbp3P47878 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Igfbp3P47878 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Igfbp3P47878 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp3P47878 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Igfbp3P47878 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Igfbp3P47878 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Igfbp3P47878 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Igfbp3P47878 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Igfbp3P47878 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Igfbp3P47878 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Igfbp3P47878 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Igfbp3P47878 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Igfbp3P47878 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Igfbp3P47878 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Igfbp3P47878 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Igfbp3P47878 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Igfbp3P47878 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igfbp3P47878 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igfbp3P47878 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igfbp3P47878 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Igfbp3P47878 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Igfbp3P47878 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igfbp3P47878 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igfbp3P47878 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igfbp3P47878 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igfbp3P47878 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igfbp3P47878 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Igfbp3P47878 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Igfbp3P47878 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igfbp3P47878 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igfbp3P47878 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igfbp3P47878 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igfbp3P47878 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igfbp3P47878 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp3P47878 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igfbp3P47878 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igfbp3P47878 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igfbp3P47878 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igfbp3P47878 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igfbp3P47878 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igfbp3P47878 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igfbp3P47878 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Igfbp3P47878 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Igfbp3P47878 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igfbp3P47878 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igfbp3P47878 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igfbp3P47878 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igfbp3P47878 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp3P47878 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igfbp3P47878 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igfbp3P47878 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igfbp3P47878 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igfbp3P47878 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igfbp3P47878 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igfbp3P47878 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igfbp3P47878 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igfbp3P47878 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igfbp3P47878 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igfbp3P47878 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms