Protein–RNA interactions for Protein: P47746

Cnr1, Cannabinoid receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnr1P47746 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnr1P47746 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnr1P47746 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnr1P47746 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnr1P47746 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnr1P47746 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnr1P47746 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnr1P47746 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnr1P47746 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnr1P47746 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnr1P47746 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnr1P47746 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnr1P47746 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnr1P47746 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnr1P47746 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnr1P47746 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnr1P47746 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnr1P47746 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnr1P47746 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnr1P47746 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnr1P47746 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnr1P47746 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnr1P47746 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnr1P47746 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnr1P47746 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnr1P47746 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnr1P47746 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnr1P47746 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnr1P47746 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnr1P47746 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnr1P47746 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnr1P47746 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnr1P47746 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnr1P47746 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnr1P47746 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnr1P47746 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnr1P47746 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnr1P47746 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnr1P47746 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnr1P47746 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnr1P47746 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnr1P47746 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnr1P47746 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnr1P47746 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnr1P47746 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnr1P47746 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnr1P47746 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnr1P47746 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnr1P47746 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cnr1P47746 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnr1P47746 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnr1P47746 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnr1P47746 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnr1P47746 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnr1P47746 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnr1P47746 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnr1P47746 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnr1P47746 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnr1P47746 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnr1P47746 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnr1P47746 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnr1P47746 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnr1P47746 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnr1P47746 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnr1P47746 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnr1P47746 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnr1P47746 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnr1P47746 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnr1P47746 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnr1P47746 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnr1P47746 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnr1P47746 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnr1P47746 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnr1P47746 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnr1P47746 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnr1P47746 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnr1P47746 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnr1P47746 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnr1P47746 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnr1P47746 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnr1P47746 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnr1P47746 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnr1P47746 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnr1P47746 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnr1P47746 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnr1P47746 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnr1P47746 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnr1P47746 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnr1P47746 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnr1P47746 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnr1P47746 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnr1P47746 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnr1P47746 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnr1P47746 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnr1P47746 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnr1P47746 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnr1P47746 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnr1P47746 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnr1P47746 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnr1P47746 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms