Protein–RNA interactions for Protein: P42128

Foxk1, Forkhead box protein K1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxk1P42128 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxk1P42128 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxk1P42128 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxk1P42128 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxk1P42128 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxk1P42128 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxk1P42128 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxk1P42128 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxk1P42128 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxk1P42128 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxk1P42128 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxk1P42128 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxk1P42128 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxk1P42128 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Foxk1P42128 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxk1P42128 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Foxk1P42128 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxk1P42128 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxk1P42128 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxk1P42128 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxk1P42128 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxk1P42128 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxk1P42128 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Foxk1P42128 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Foxk1P42128 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxk1P42128 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxk1P42128 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxk1P42128 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxk1P42128 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxk1P42128 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxk1P42128 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxk1P42128 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxk1P42128 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxk1P42128 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxk1P42128 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxk1P42128 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxk1P42128 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxk1P42128 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxk1P42128 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxk1P42128 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxk1P42128 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxk1P42128 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxk1P42128 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxk1P42128 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxk1P42128 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxk1P42128 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxk1P42128 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxk1P42128 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxk1P42128 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxk1P42128 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxk1P42128 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxk1P42128 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxk1P42128 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxk1P42128 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxk1P42128 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxk1P42128 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Foxk1P42128 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxk1P42128 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxk1P42128 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxk1P42128 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxk1P42128 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxk1P42128 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxk1P42128 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxk1P42128 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxk1P42128 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxk1P42128 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxk1P42128 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxk1P42128 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxk1P42128 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxk1P42128 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxk1P42128 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxk1P42128 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxk1P42128 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxk1P42128 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxk1P42128 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxk1P42128 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxk1P42128 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxk1P42128 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxk1P42128 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxk1P42128 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxk1P42128 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxk1P42128 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxk1P42128 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxk1P42128 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxk1P42128 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxk1P42128 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxk1P42128 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxk1P42128 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxk1P42128 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxk1P42128 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Foxk1P42128 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxk1P42128 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxk1P42128 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxk1P42128 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxk1P42128 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxk1P42128 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxk1P42128 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxk1P42128 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxk1P42128 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxk1P42128 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms