Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col8a2P25318 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col8a2P25318 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col8a2P25318 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col8a2P25318 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col8a2P25318 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col8a2P25318 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col8a2P25318 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col8a2P25318 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col8a2P25318 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col8a2P25318 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col8a2P25318 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col8a2P25318 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col8a2P25318 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col8a2P25318 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col8a2P25318 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col8a2P25318 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col8a2P25318 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col8a2P25318 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col8a2P25318 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col8a2P25318 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col8a2P25318 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col8a2P25318 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col8a2P25318 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col8a2P25318 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col8a2P25318 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col8a2P25318 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col8a2P25318 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col8a2P25318 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col8a2P25318 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col8a2P25318 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col8a2P25318 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col8a2P25318 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col8a2P25318 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col8a2P25318 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col8a2P25318 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col8a2P25318 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col8a2P25318 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col8a2P25318 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col8a2P25318 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Col8a2P25318 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col8a2P25318 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col8a2P25318 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col8a2P25318 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col8a2P25318 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col8a2P25318 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Col8a2P25318 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Col8a2P25318 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col8a2P25318 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col8a2P25318 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col8a2P25318 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col8a2P25318 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col8a2P25318 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col8a2P25318 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col8a2P25318 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col8a2P25318 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Col8a2P25318 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col8a2P25318 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col8a2P25318 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col8a2P25318 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col8a2P25318 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col8a2P25318 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col8a2P25318 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col8a2P25318 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col8a2P25318 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col8a2P25318 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col8a2P25318 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col8a2P25318 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col8a2P25318 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col8a2P25318 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col8a2P25318 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col8a2P25318 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Col8a2P25318 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col8a2P25318 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col8a2P25318 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col8a2P25318 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col8a2P25318 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col8a2P25318 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col8a2P25318 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col8a2P25318 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col8a2P25318 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col8a2P25318 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col8a2P25318 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col8a2P25318 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col8a2P25318 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col8a2P25318 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col8a2P25318 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Col8a2P25318 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col8a2P25318 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col8a2P25318 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col8a2P25318 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col8a2P25318 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col8a2P25318 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col8a2P25318 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col8a2P25318 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Col8a2P25318 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col8a2P25318 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col8a2P25318 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col8a2P25318 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col8a2P25318 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms