Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tsta3P23591 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tsta3P23591 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tsta3P23591 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tsta3P23591 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tsta3P23591 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tsta3P23591 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tsta3P23591 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tsta3P23591 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tsta3P23591 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tsta3P23591 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tsta3P23591 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tsta3P23591 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tsta3P23591 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tsta3P23591 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tsta3P23591 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tsta3P23591 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tsta3P23591 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tsta3P23591 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tsta3P23591 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tsta3P23591 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tsta3P23591 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tsta3P23591 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tsta3P23591 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tsta3P23591 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tsta3P23591 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tsta3P23591 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tsta3P23591 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tsta3P23591 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tsta3P23591 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tsta3P23591 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tsta3P23591 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tsta3P23591 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tsta3P23591 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tsta3P23591 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tsta3P23591 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tsta3P23591 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tsta3P23591 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tsta3P23591 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tsta3P23591 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsta3P23591 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsta3P23591 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsta3P23591 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsta3P23591 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tsta3P23591 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tsta3P23591 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tsta3P23591 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tsta3P23591 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Tsta3P23591 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tsta3P23591 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Tsta3P23591 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tsta3P23591 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tsta3P23591 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tsta3P23591 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tsta3P23591 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tsta3P23591 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tsta3P23591 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tsta3P23591 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tsta3P23591 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Tsta3P23591 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tsta3P23591 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tsta3P23591 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tsta3P23591 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tsta3P23591 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tsta3P23591 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tsta3P23591 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tsta3P23591 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tsta3P23591 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tsta3P23591 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tsta3P23591 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tsta3P23591 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tsta3P23591 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsta3P23591 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsta3P23591 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsta3P23591 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsta3P23591 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsta3P23591 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsta3P23591 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsta3P23591 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsta3P23591 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsta3P23591 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsta3P23591 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsta3P23591 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsta3P23591 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tsta3P23591 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Tsta3P23591 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsta3P23591 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsta3P23591 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsta3P23591 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tsta3P23591 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tsta3P23591 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tsta3P23591 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tsta3P23591 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tsta3P23591 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tsta3P23591 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tsta3P23591 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tsta3P23591 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tsta3P23591 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tsta3P23591 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tsta3P23591 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms