Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Xrcc6P23475 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Xrcc6P23475 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Xrcc6P23475 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Xrcc6P23475 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Xrcc6P23475 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Xrcc6P23475 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Xrcc6P23475 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Xrcc6P23475 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Xrcc6P23475 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Xrcc6P23475 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Xrcc6P23475 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Xrcc6P23475 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Xrcc6P23475 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Xrcc6P23475 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Xrcc6P23475 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Xrcc6P23475 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Xrcc6P23475 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Xrcc6P23475 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Xrcc6P23475 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Xrcc6P23475 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Xrcc6P23475 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Xrcc6P23475 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Xrcc6P23475 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Xrcc6P23475 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Xrcc6P23475 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Xrcc6P23475 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Xrcc6P23475 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Xrcc6P23475 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Xrcc6P23475 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Xrcc6P23475 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Xrcc6P23475 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Xrcc6P23475 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Xrcc6P23475 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Xrcc6P23475 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Xrcc6P23475 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Xrcc6P23475 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Xrcc6P23475 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Xrcc6P23475 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Xrcc6P23475 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Xrcc6P23475 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Xrcc6P23475 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Xrcc6P23475 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Xrcc6P23475 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Xrcc6P23475 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Xrcc6P23475 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Xrcc6P23475 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Xrcc6P23475 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Xrcc6P23475 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Xrcc6P23475 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Xrcc6P23475 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrcc6P23475 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrcc6P23475 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Xrcc6P23475 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Xrcc6P23475 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Xrcc6P23475 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Xrcc6P23475 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Xrcc6P23475 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Xrcc6P23475 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Xrcc6P23475 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Xrcc6P23475 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Xrcc6P23475 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Xrcc6P23475 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Xrcc6P23475 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Xrcc6P23475 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Xrcc6P23475 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Xrcc6P23475 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Xrcc6P23475 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Xrcc6P23475 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Xrcc6P23475 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Xrcc6P23475 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Xrcc6P23475 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Xrcc6P23475 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Xrcc6P23475 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Xrcc6P23475 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Xrcc6P23475 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Xrcc6P23475 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Xrcc6P23475 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Xrcc6P23475 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Xrcc6P23475 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Xrcc6P23475 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Xrcc6P23475 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Xrcc6P23475 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Xrcc6P23475 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Xrcc6P23475 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Xrcc6P23475 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Xrcc6P23475 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Xrcc6P23475 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Xrcc6P23475 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Xrcc6P23475 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Xrcc6P23475 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Xrcc6P23475 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Xrcc6P23475 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Xrcc6P23475 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Xrcc6P23475 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Xrcc6P23475 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Xrcc6P23475 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Xrcc6P23475 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Xrcc6P23475 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Xrcc6P23475 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms