Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Eif3aP23116 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Eif3aP23116 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Eif3aP23116 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Eif3aP23116 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Eif3aP23116 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Eif3aP23116 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Eif3aP23116 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Eif3aP23116 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Eif3aP23116 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Eif3aP23116 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Eif3aP23116 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Eif3aP23116 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Eif3aP23116 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Eif3aP23116 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Eif3aP23116 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Eif3aP23116 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Eif3aP23116 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Eif3aP23116 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Eif3aP23116 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Eif3aP23116 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Eif3aP23116 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Eif3aP23116 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Eif3aP23116 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Eif3aP23116 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Eif3aP23116 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Eif3aP23116 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Eif3aP23116 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Eif3aP23116 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Eif3aP23116 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Eif3aP23116 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Eif3aP23116 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Eif3aP23116 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Eif3aP23116 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Eif3aP23116 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Eif3aP23116 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Eif3aP23116 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Eif3aP23116 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Eif3aP23116 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Eif3aP23116 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Eif3aP23116 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Eif3aP23116 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Eif3aP23116 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Eif3aP23116 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Eif3aP23116 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Eif3aP23116 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Eif3aP23116 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Eif3aP23116 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Eif3aP23116 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Eif3aP23116 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Eif3aP23116 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Eif3aP23116 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Eif3aP23116 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Eif3aP23116 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Eif3aP23116 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Eif3aP23116 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Eif3aP23116 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Eif3aP23116 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Eif3aP23116 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Eif3aP23116 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Eif3aP23116 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Eif3aP23116 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Eif3aP23116 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Eif3aP23116 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Eif3aP23116 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Eif3aP23116 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Eif3aP23116 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Eif3aP23116 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Eif3aP23116 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Eif3aP23116 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Eif3aP23116 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Eif3aP23116 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Eif3aP23116 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Eif3aP23116 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Eif3aP23116 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Eif3aP23116 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Eif3aP23116 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Eif3aP23116 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Eif3aP23116 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Eif3aP23116 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Eif3aP23116 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Eif3aP23116 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Eif3aP23116 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Eif3aP23116 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Eif3aP23116 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Eif3aP23116 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Eif3aP23116 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Eif3aP23116 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Eif3aP23116 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Eif3aP23116 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Eif3aP23116 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Eif3aP23116 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Eif3aP23116 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Eif3aP23116 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Eif3aP23116 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Eif3aP23116 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Eif3aP23116 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Eif3aP23116 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Eif3aP23116 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Eif3aP23116 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms