Protein–RNA interactions for Protein: P21658

Fgf6, Fibroblast growth factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf6P21658 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf6P21658 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf6P21658 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf6P21658 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf6P21658 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf6P21658 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf6P21658 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf6P21658 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf6P21658 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf6P21658 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf6P21658 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf6P21658 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf6P21658 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf6P21658 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf6P21658 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf6P21658 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf6P21658 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf6P21658 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf6P21658 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf6P21658 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf6P21658 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf6P21658 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgf6P21658 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgf6P21658 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgf6P21658 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgf6P21658 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgf6P21658 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf6P21658 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf6P21658 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgf6P21658 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf6P21658 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf6P21658 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf6P21658 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf6P21658 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf6P21658 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf6P21658 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf6P21658 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf6P21658 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf6P21658 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf6P21658 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf6P21658 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf6P21658 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf6P21658 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf6P21658 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf6P21658 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf6P21658 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf6P21658 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgf6P21658 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgf6P21658 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf6P21658 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf6P21658 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgf6P21658 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgf6P21658 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fgf6P21658 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fgf6P21658 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fgf6P21658 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgf6P21658 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgf6P21658 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgf6P21658 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgf6P21658 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf6P21658 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf6P21658 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf6P21658 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf6P21658 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf6P21658 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf6P21658 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf6P21658 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf6P21658 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf6P21658 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf6P21658 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf6P21658 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf6P21658 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf6P21658 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf6P21658 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf6P21658 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf6P21658 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf6P21658 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf6P21658 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf6P21658 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf6P21658 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf6P21658 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms