Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tpm3P21107 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tpm3P21107 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tpm3P21107 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tpm3P21107 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tpm3P21107 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tpm3P21107 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tpm3P21107 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tpm3P21107 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tpm3P21107 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tpm3P21107 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tpm3P21107 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tpm3P21107 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tpm3P21107 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tpm3P21107 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tpm3P21107 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tpm3P21107 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Tpm3P21107 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tpm3P21107 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tpm3P21107 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tpm3P21107 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tpm3P21107 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tpm3P21107 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tpm3P21107 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tpm3P21107 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tpm3P21107 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tpm3P21107 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tpm3P21107 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tpm3P21107 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Tpm3P21107 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tpm3P21107 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tpm3P21107 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tpm3P21107 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tpm3P21107 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tpm3P21107 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tpm3P21107 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tpm3P21107 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tpm3P21107 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tpm3P21107 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tpm3P21107 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tpm3P21107 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tpm3P21107 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tpm3P21107 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tpm3P21107 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tpm3P21107 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tpm3P21107 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tpm3P21107 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tpm3P21107 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tpm3P21107 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tpm3P21107 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tpm3P21107 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tpm3P21107 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tpm3P21107 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tpm3P21107 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tpm3P21107 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tpm3P21107 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tpm3P21107 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tpm3P21107 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tpm3P21107 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tpm3P21107 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tpm3P21107 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tpm3P21107 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tpm3P21107 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Tpm3P21107 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tpm3P21107 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tpm3P21107 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Tpm3P21107 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tpm3P21107 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tpm3P21107 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tpm3P21107 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tpm3P21107 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tpm3P21107 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tpm3P21107 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tpm3P21107 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tpm3P21107 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tpm3P21107 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tpm3P21107 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tpm3P21107 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tpm3P21107 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tpm3P21107 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tpm3P21107 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tpm3P21107 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tpm3P21107 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tpm3P21107 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tpm3P21107 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tpm3P21107 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tpm3P21107 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tpm3P21107 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tpm3P21107 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tpm3P21107 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tpm3P21107 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tpm3P21107 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tpm3P21107 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpm3P21107 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tpm3P21107 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tpm3P21107 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tpm3P21107 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tpm3P21107 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tpm3P21107 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpm3P21107 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms