Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim30aP15533 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim30aP15533 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim30aP15533 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim30aP15533 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim30aP15533 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim30aP15533 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim30aP15533 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim30aP15533 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trim30aP15533 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim30aP15533 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim30aP15533 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim30aP15533 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim30aP15533 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim30aP15533 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim30aP15533 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim30aP15533 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim30aP15533 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim30aP15533 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim30aP15533 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim30aP15533 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim30aP15533 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim30aP15533 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim30aP15533 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim30aP15533 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim30aP15533 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trim30aP15533 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim30aP15533 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim30aP15533 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trim30aP15533 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trim30aP15533 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trim30aP15533 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim30aP15533 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trim30aP15533 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim30aP15533 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim30aP15533 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim30aP15533 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim30aP15533 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim30aP15533 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim30aP15533 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim30aP15533 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim30aP15533 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim30aP15533 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim30aP15533 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim30aP15533 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim30aP15533 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim30aP15533 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim30aP15533 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim30aP15533 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim30aP15533 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim30aP15533 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim30aP15533 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim30aP15533 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Trim30aP15533 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Trim30aP15533 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim30aP15533 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim30aP15533 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim30aP15533 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim30aP15533 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim30aP15533 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim30aP15533 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim30aP15533 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim30aP15533 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trim30aP15533 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trim30aP15533 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim30aP15533 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim30aP15533 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim30aP15533 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim30aP15533 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim30aP15533 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim30aP15533 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim30aP15533 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim30aP15533 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim30aP15533 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim30aP15533 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim30aP15533 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim30aP15533 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim30aP15533 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim30aP15533 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim30aP15533 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim30aP15533 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim30aP15533 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim30aP15533 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim30aP15533 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim30aP15533 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim30aP15533 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim30aP15533 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim30aP15533 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim30aP15533 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim30aP15533 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim30aP15533 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim30aP15533 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim30aP15533 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim30aP15533 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim30aP15533 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim30aP15533 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim30aP15533 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim30aP15533 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trim30aP15533 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trim30aP15533 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.1 ms