Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casp8O89110 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casp8O89110 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Casp8O89110 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casp8O89110 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Casp8O89110 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Casp8O89110 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casp8O89110 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casp8O89110 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Casp8O89110 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casp8O89110 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casp8O89110 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Casp8O89110 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Casp8O89110 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Casp8O89110 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Casp8O89110 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Casp8O89110 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casp8O89110 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casp8O89110 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casp8O89110 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casp8O89110 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Casp8O89110 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casp8O89110 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casp8O89110 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Casp8O89110 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casp8O89110 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casp8O89110 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casp8O89110 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casp8O89110 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp8O89110 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp8O89110 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp8O89110 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Casp8O89110 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casp8O89110 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casp8O89110 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Casp8O89110 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casp8O89110 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casp8O89110 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casp8O89110 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casp8O89110 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp8O89110 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casp8O89110 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casp8O89110 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casp8O89110 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Casp8O89110 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casp8O89110 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casp8O89110 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp8O89110 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp8O89110 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp8O89110 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp8O89110 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp8O89110 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casp8O89110 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Casp8O89110 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp8O89110 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp8O89110 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp8O89110 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp8O89110 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp8O89110 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp8O89110 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp8O89110 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casp8O89110 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casp8O89110 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casp8O89110 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casp8O89110 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casp8O89110 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casp8O89110 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casp8O89110 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Casp8O89110 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casp8O89110 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp8O89110 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp8O89110 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp8O89110 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp8O89110 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casp8O89110 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casp8O89110 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casp8O89110 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp8O89110 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp8O89110 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp8O89110 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp8O89110 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp8O89110 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp8O89110 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp8O89110 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp8O89110 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp8O89110 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casp8O89110 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp8O89110 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Casp8O89110 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Casp8O89110 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Casp8O89110 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp8O89110 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp8O89110 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp8O89110 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp8O89110 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp8O89110 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp8O89110 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp8O89110 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp8O89110 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp8O89110 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms