Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Tom1O88746 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Tom1O88746 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Tom1O88746 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Tom1O88746 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Tom1O88746 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Tom1O88746 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Tom1O88746 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Tom1O88746 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Tom1O88746 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Tom1O88746 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Tom1O88746 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Tom1O88746 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Tom1O88746 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Tom1O88746 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Tom1O88746 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Tom1O88746 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Tom1O88746 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Tom1O88746 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Tom1O88746 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Tom1O88746 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Tom1O88746 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Tom1O88746 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Tom1O88746 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Tom1O88746 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Tom1O88746 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Tom1O88746 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Tom1O88746 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Tom1O88746 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Tom1O88746 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Tom1O88746 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Tom1O88746 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Tom1O88746 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Tom1O88746 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Tom1O88746 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Tom1O88746 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Tom1O88746 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Tom1O88746 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Tom1O88746 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Tom1O88746 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Tom1O88746 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Tom1O88746 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Tom1O88746 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Tom1O88746 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Tom1O88746 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Tom1O88746 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Tom1O88746 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Tom1O88746 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Tom1O88746 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Tom1O88746 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Tom1O88746 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Tom1O88746 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Tom1O88746 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Tom1O88746 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Tom1O88746 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Tom1O88746 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Tom1O88746 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Tom1O88746 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Tom1O88746 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Tom1O88746 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Tom1O88746 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Tom1O88746 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Tom1O88746 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Tom1O88746 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Tom1O88746 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Tom1O88746 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Tom1O88746 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Tom1O88746 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Tom1O88746 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Tom1O88746 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Tom1O88746 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Tom1O88746 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Tom1O88746 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Tom1O88746 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Tom1O88746 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Tom1O88746 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Tom1O88746 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Tom1O88746 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Tom1O88746 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Tom1O88746 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Tom1O88746 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Tom1O88746 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Tom1O88746 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Tom1O88746 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Tom1O88746 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Tom1O88746 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Tom1O88746 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Tom1O88746 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Tom1O88746 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Tom1O88746 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Tom1O88746 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Tom1O88746 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Tom1O88746 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Tom1O88746 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Tom1O88746 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Tom1O88746 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Tom1O88746 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Tom1O88746 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Tom1O88746 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Tom1O88746 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms