Protein–RNA interactions for Protein: O88487

Dync1i2, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i2O88487 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dync1i2O88487 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dync1i2O88487 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Dync1i2O88487 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Dync1i2O88487 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dync1i2O88487 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dync1i2O88487 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dync1i2O88487 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dync1i2O88487 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dync1i2O88487 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dync1i2O88487 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dync1i2O88487 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dync1i2O88487 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Dync1i2O88487 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dync1i2O88487 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dync1i2O88487 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dync1i2O88487 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dync1i2O88487 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dync1i2O88487 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dync1i2O88487 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dync1i2O88487 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dync1i2O88487 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dync1i2O88487 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dync1i2O88487 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dync1i2O88487 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dync1i2O88487 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Dync1i2O88487 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dync1i2O88487 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dync1i2O88487 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dync1i2O88487 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dync1i2O88487 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dync1i2O88487 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dync1i2O88487 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dync1i2O88487 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dync1i2O88487 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dync1i2O88487 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dync1i2O88487 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Dync1i2O88487 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dync1i2O88487 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dync1i2O88487 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dync1i2O88487 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dync1i2O88487 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dync1i2O88487 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dync1i2O88487 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dync1i2O88487 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dync1i2O88487 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dync1i2O88487 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dync1i2O88487 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dync1i2O88487 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dync1i2O88487 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dync1i2O88487 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dync1i2O88487 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dync1i2O88487 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dync1i2O88487 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dync1i2O88487 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dync1i2O88487 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dync1i2O88487 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dync1i2O88487 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dync1i2O88487 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dync1i2O88487 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dync1i2O88487 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dync1i2O88487 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dync1i2O88487 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dync1i2O88487 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dync1i2O88487 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dync1i2O88487 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dync1i2O88487 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dync1i2O88487 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Dync1i2O88487 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dync1i2O88487 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dync1i2O88487 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dync1i2O88487 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dync1i2O88487 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dync1i2O88487 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dync1i2O88487 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dync1i2O88487 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dync1i2O88487 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Dync1i2O88487 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dync1i2O88487 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dync1i2O88487 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dync1i2O88487 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dync1i2O88487 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dync1i2O88487 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dync1i2O88487 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dync1i2O88487 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dync1i2O88487 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dync1i2O88487 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dync1i2O88487 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dync1i2O88487 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dync1i2O88487 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dync1i2O88487 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dync1i2O88487 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dync1i2O88487 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dync1i2O88487 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dync1i2O88487 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dync1i2O88487 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dync1i2O88487 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dync1i2O88487 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dync1i2O88487 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dync1i2O88487 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms