Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Alx3O70137 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Alx3O70137 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Alx3O70137 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Alx3O70137 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Alx3O70137 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Alx3O70137 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Alx3O70137 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Alx3O70137 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Alx3O70137 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alx3O70137 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Alx3O70137 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alx3O70137 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alx3O70137 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alx3O70137 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alx3O70137 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alx3O70137 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alx3O70137 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Alx3O70137 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Alx3O70137 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alx3O70137 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alx3O70137 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alx3O70137 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alx3O70137 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alx3O70137 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Alx3O70137 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alx3O70137 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alx3O70137 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alx3O70137 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alx3O70137 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alx3O70137 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Alx3O70137 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alx3O70137 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alx3O70137 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alx3O70137 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alx3O70137 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alx3O70137 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alx3O70137 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alx3O70137 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alx3O70137 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alx3O70137 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Alx3O70137 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Alx3O70137 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alx3O70137 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alx3O70137 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alx3O70137 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alx3O70137 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Alx3O70137 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alx3O70137 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alx3O70137 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alx3O70137 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alx3O70137 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Alx3O70137 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alx3O70137 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alx3O70137 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alx3O70137 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alx3O70137 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alx3O70137 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alx3O70137 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alx3O70137 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alx3O70137 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alx3O70137 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alx3O70137 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alx3O70137 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alx3O70137 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alx3O70137 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alx3O70137 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alx3O70137 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alx3O70137 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alx3O70137 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alx3O70137 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alx3O70137 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alx3O70137 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Alx3O70137 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alx3O70137 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alx3O70137 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alx3O70137 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Alx3O70137 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Alx3O70137 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alx3O70137 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alx3O70137 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alx3O70137 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Alx3O70137 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Alx3O70137 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Alx3O70137 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alx3O70137 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alx3O70137 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alx3O70137 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alx3O70137 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alx3O70137 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alx3O70137 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alx3O70137 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alx3O70137 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alx3O70137 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alx3O70137 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Alx3O70137 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alx3O70137 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alx3O70137 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alx3O70137 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alx3O70137 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms