Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Pkd2O35245 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Pkd2O35245 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Pkd2O35245 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Pkd2O35245 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Pkd2O35245 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Pkd2O35245 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Pkd2O35245 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Pkd2O35245 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Pkd2O35245 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Pkd2O35245 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Pkd2O35245 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Pkd2O35245 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Pkd2O35245 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Pkd2O35245 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Pkd2O35245 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Pkd2O35245 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Pkd2O35245 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Pkd2O35245 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Pkd2O35245 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Pkd2O35245 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Pkd2O35245 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
Pkd2O35245 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Pkd2O35245 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Pkd2O35245 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Pkd2O35245 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Pkd2O35245 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Pkd2O35245 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Pkd2O35245 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Pkd2O35245 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Pkd2O35245 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Pkd2O35245 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Pkd2O35245 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Pkd2O35245 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Pkd2O35245 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Pkd2O35245 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Pkd2O35245 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Pkd2O35245 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Pkd2O35245 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Pkd2O35245 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Pkd2O35245 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Pkd2O35245 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Pkd2O35245 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Pkd2O35245 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Pkd2O35245 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Pkd2O35245 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Pkd2O35245 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Pkd2O35245 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Pkd2O35245 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Pkd2O35245 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Pkd2O35245 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Pkd2O35245 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Pkd2O35245 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Pkd2O35245 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Pkd2O35245 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Pkd2O35245 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Pkd2O35245 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Pkd2O35245 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Pkd2O35245 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Pkd2O35245 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Pkd2O35245 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Pkd2O35245 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Pkd2O35245 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Pkd2O35245 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Pkd2O35245 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Pkd2O35245 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Pkd2O35245 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Pkd2O35245 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Pkd2O35245 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Pkd2O35245 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Pkd2O35245 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Pkd2O35245 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Pkd2O35245 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Pkd2O35245 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Pkd2O35245 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
Pkd2O35245 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Pkd2O35245 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Pkd2O35245 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Pkd2O35245 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Pkd2O35245 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Pkd2O35245 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Pkd2O35245 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Pkd2O35245 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Pkd2O35245 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Pkd2O35245 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Pkd2O35245 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Pkd2O35245 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Pkd2O35245 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Pkd2O35245 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Pkd2O35245 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Pkd2O35245 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Pkd2O35245 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Pkd2O35245 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Pkd2O35245 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Pkd2O35245 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Pkd2O35245 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Pkd2O35245 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Pkd2O35245 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Pkd2O35245 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Pkd2O35245 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms