Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H2-M9O19442 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
H2-M9O19442 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2-M9O19442 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2-M9O19442 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2-M9O19442 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2-M9O19442 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2-M9O19442 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2-M9O19442 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H2-M9O19442 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H2-M9O19442 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H2-M9O19442 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H2-M9O19442 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2-M9O19442 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H2-M9O19442 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H2-M9O19442 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H2-M9O19442 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H2-M9O19442 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H2-M9O19442 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H2-M9O19442 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
H2-M9O19442 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H2-M9O19442 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H2-M9O19442 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H2-M9O19442 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
H2-M9O19442 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
H2-M9O19442 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H2-M9O19442 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H2-M9O19442 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
H2-M9O19442 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H2-M9O19442 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H2-M9O19442 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2-M9O19442 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2-M9O19442 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H2-M9O19442 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2-M9O19442 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H2-M9O19442 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2-M9O19442 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2-M9O19442 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2-M9O19442 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2-M9O19442 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2-M9O19442 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2-M9O19442 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2-M9O19442 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2-M9O19442 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2-M9O19442 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2-M9O19442 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2-M9O19442 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
H2-M9O19442 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H2-M9O19442 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H2-M9O19442 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2-M9O19442 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
H2-M9O19442 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
H2-M9O19442 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2-M9O19442 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2-M9O19442 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2-M9O19442 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2-M9O19442 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2-M9O19442 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2-M9O19442 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H2-M9O19442 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H2-M9O19442 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2-M9O19442 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2-M9O19442 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2-M9O19442 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
H2-M9O19442 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H2-M9O19442 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2-M9O19442 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2-M9O19442 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2-M9O19442 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
H2-M9O19442 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2-M9O19442 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2-M9O19442 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2-M9O19442 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2-M9O19442 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2-M9O19442 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H2-M9O19442 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2-M9O19442 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2-M9O19442 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2-M9O19442 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2-M9O19442 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2-M9O19442 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2-M9O19442 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2-M9O19442 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
H2-M9O19442 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2-M9O19442 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2-M9O19442 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2-M9O19442 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2-M9O19442 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2-M9O19442 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2-M9O19442 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2-M9O19442 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2-M9O19442 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2-M9O19442 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2-M9O19442 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2-M9O19442 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2-M9O19442 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H2-M9O19442 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
H2-M9O19442 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2-M9O19442 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2-M9O19442 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms