Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5458L7N219 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5458L7N219 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5458L7N219 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5458L7N219 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5458L7N219 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5458L7N219 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5458L7N219 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5458L7N219 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5458L7N219 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5458L7N219 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5458L7N219 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5458L7N219 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5458L7N219 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5458L7N219 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5458L7N219 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5458L7N219 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5458L7N219 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5458L7N219 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5458L7N219 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5458L7N219 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5458L7N219 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5458L7N219 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5458L7N219 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5458L7N219 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5458L7N219 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5458L7N219 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5458L7N219 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5458L7N219 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5458L7N219 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5458L7N219 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5458L7N219 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5458L7N219 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5458L7N219 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5458L7N219 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5458L7N219 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5458L7N219 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5458L7N219 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5458L7N219 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5458L7N219 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5458L7N219 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5458L7N219 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5458L7N219 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5458L7N219 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5458L7N219 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5458L7N219 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5458L7N219 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5458L7N219 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm5458L7N219 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5458L7N219 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5458L7N219 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5458L7N219 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5458L7N219 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5458L7N219 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5458L7N219 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5458L7N219 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5458L7N219 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5458L7N219 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5458L7N219 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5458L7N219 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5458L7N219 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5458L7N219 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5458L7N219 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5458L7N219 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5458L7N219 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5458L7N219 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm5458L7N219 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5458L7N219 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5458L7N219 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5458L7N219 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5458L7N219 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5458L7N219 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5458L7N219 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5458L7N219 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5458L7N219 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5458L7N219 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5458L7N219 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5458L7N219 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5458L7N219 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5458L7N219 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5458L7N219 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5458L7N219 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5458L7N219 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5458L7N219 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5458L7N219 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5458L7N219 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5458L7N219 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5458L7N219 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5458L7N219 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5458L7N219 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5458L7N219 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5458L7N219 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5458L7N219 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5458L7N219 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5458L7N219 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5458L7N219 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5458L7N219 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm5458L7N219 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm5458L7N219 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm5458L7N219 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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