Protein–RNA interactions for Protein: J3QPK1

Gm21833, Predicted gene, 21833, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21833J3QPK1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm21833J3QPK1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm21833J3QPK1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm21833J3QPK1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21833J3QPK1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21833J3QPK1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21833J3QPK1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21833J3QPK1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21833J3QPK1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm21833J3QPK1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21833J3QPK1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21833J3QPK1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm21833J3QPK1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm21833J3QPK1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm21833J3QPK1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21833J3QPK1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21833J3QPK1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21833J3QPK1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21833J3QPK1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21833J3QPK1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21833J3QPK1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21833J3QPK1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21833J3QPK1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21833J3QPK1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21833J3QPK1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21833J3QPK1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21833J3QPK1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21833J3QPK1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21833J3QPK1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21833J3QPK1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21833J3QPK1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21833J3QPK1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21833J3QPK1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21833J3QPK1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21833J3QPK1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21833J3QPK1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21833J3QPK1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21833J3QPK1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21833J3QPK1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21833J3QPK1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21833J3QPK1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21833J3QPK1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21833J3QPK1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21833J3QPK1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21833J3QPK1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21833J3QPK1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21833J3QPK1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21833J3QPK1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21833J3QPK1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21833J3QPK1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21833J3QPK1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21833J3QPK1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21833J3QPK1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21833J3QPK1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21833J3QPK1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21833J3QPK1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21833J3QPK1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21833J3QPK1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21833J3QPK1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21833J3QPK1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21833J3QPK1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21833J3QPK1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21833J3QPK1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21833J3QPK1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21833J3QPK1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21833J3QPK1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21833J3QPK1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21833J3QPK1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21833J3QPK1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21833J3QPK1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21833J3QPK1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21833J3QPK1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21833J3QPK1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21833J3QPK1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21833J3QPK1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21833J3QPK1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21833J3QPK1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21833J3QPK1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21833J3QPK1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21833J3QPK1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21833J3QPK1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm21833J3QPK1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21833J3QPK1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21833J3QPK1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21833J3QPK1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21833J3QPK1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21833J3QPK1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21833J3QPK1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21833J3QPK1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21833J3QPK1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21833J3QPK1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21833J3QPK1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21833J3QPK1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21833J3QPK1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21833J3QPK1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21833J3QPK1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21833J3QPK1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21833J3QPK1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21833J3QPK1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21833J3QPK1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms