Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21972J3QN38 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21972J3QN38 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21972J3QN38 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21972J3QN38 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21972J3QN38 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21972J3QN38 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21972J3QN38 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21972J3QN38 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21972J3QN38 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21972J3QN38 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21972J3QN38 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21972J3QN38 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm21972J3QN38 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21972J3QN38 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21972J3QN38 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21972J3QN38 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21972J3QN38 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21972J3QN38 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21972J3QN38 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21972J3QN38 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21972J3QN38 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21972J3QN38 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21972J3QN38 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21972J3QN38 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21972J3QN38 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21972J3QN38 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21972J3QN38 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21972J3QN38 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21972J3QN38 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm21972J3QN38 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm21972J3QN38 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm21972J3QN38 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm21972J3QN38 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm21972J3QN38 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm21972J3QN38 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm21972J3QN38 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm21972J3QN38 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm21972J3QN38 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm21972J3QN38 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm21972J3QN38 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm21972J3QN38 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm21972J3QN38 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm21972J3QN38 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm21972J3QN38 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm21972J3QN38 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm21972J3QN38 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm21972J3QN38 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm21972J3QN38 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm21972J3QN38 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm21972J3QN38 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm21972J3QN38 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm21972J3QN38 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm21972J3QN38 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm21972J3QN38 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21972J3QN38 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21972J3QN38 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21972J3QN38 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21972J3QN38 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21972J3QN38 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21972J3QN38 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21972J3QN38 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21972J3QN38 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21972J3QN38 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm21972J3QN38 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm21972J3QN38 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm21972J3QN38 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm21972J3QN38 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21972J3QN38 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21972J3QN38 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21972J3QN38 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21972J3QN38 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21972J3QN38 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21972J3QN38 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21972J3QN38 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21972J3QN38 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21972J3QN38 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21972J3QN38 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm21972J3QN38 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21972J3QN38 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21972J3QN38 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21972J3QN38 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21972J3QN38 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms