Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a18J3QN01 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a18J3QN01 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ms4a18J3QN01 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ms4a18J3QN01 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ms4a18J3QN01 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ms4a18J3QN01 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ms4a18J3QN01 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ms4a18J3QN01 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ms4a18J3QN01 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ms4a18J3QN01 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ms4a18J3QN01 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ms4a18J3QN01 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ms4a18J3QN01 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a18J3QN01 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a18J3QN01 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a18J3QN01 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a18J3QN01 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a18J3QN01 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a18J3QN01 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a18J3QN01 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ms4a18J3QN01 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ms4a18J3QN01 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ms4a18J3QN01 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ms4a18J3QN01 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a18J3QN01 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a18J3QN01 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a18J3QN01 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a18J3QN01 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a18J3QN01 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a18J3QN01 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a18J3QN01 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ms4a18J3QN01 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ms4a18J3QN01 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a18J3QN01 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a18J3QN01 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a18J3QN01 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ms4a18J3QN01 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ms4a18J3QN01 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ms4a18J3QN01 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a18J3QN01 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a18J3QN01 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a18J3QN01 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a18J3QN01 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a18J3QN01 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a18J3QN01 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a18J3QN01 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a18J3QN01 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a18J3QN01 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ms4a18J3QN01 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ms4a18J3QN01 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a18J3QN01 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a18J3QN01 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a18J3QN01 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a18J3QN01 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a18J3QN01 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a18J3QN01 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a18J3QN01 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a18J3QN01 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a18J3QN01 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a18J3QN01 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a18J3QN01 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a18J3QN01 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a18J3QN01 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a18J3QN01 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ms4a18J3QN01 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a18J3QN01 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a18J3QN01 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a18J3QN01 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a18J3QN01 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ms4a18J3QN01 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ms4a18J3QN01 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a18J3QN01 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a18J3QN01 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ms4a18J3QN01 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ms4a18J3QN01 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a18J3QN01 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a18J3QN01 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a18J3QN01 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a18J3QN01 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a18J3QN01 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a18J3QN01 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a18J3QN01 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a18J3QN01 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a18J3QN01 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a18J3QN01 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a18J3QN01 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a18J3QN01 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a18J3QN01 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a18J3QN01 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a18J3QN01 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a18J3QN01 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a18J3QN01 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a18J3QN01 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ms4a18J3QN01 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a18J3QN01 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a18J3QN01 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a18J3QN01 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a18J3QN01 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a18J3QN01 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms