Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm3415J3QMS8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm3415J3QMS8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm3415J3QMS8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm3415J3QMS8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm3415J3QMS8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm3415J3QMS8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm3415J3QMS8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm3415J3QMS8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm3415J3QMS8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm3415J3QMS8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gm3415J3QMS8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm3415J3QMS8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm3415J3QMS8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm3415J3QMS8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm3415J3QMS8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm3415J3QMS8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm3415J3QMS8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm3415J3QMS8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm3415J3QMS8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm3415J3QMS8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm3415J3QMS8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gm3415J3QMS8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm3415J3QMS8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gm3415J3QMS8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm3415J3QMS8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm3415J3QMS8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gm3415J3QMS8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm3415J3QMS8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm3415J3QMS8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm3415J3QMS8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm3415J3QMS8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm3415J3QMS8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm3415J3QMS8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm3415J3QMS8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm3415J3QMS8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm3415J3QMS8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm3415J3QMS8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm3415J3QMS8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm3415J3QMS8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm3415J3QMS8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm3415J3QMS8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm3415J3QMS8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm3415J3QMS8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm3415J3QMS8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm3415J3QMS8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm3415J3QMS8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm3415J3QMS8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm3415J3QMS8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm3415J3QMS8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm3415J3QMS8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm3415J3QMS8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm3415J3QMS8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm3415J3QMS8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm3415J3QMS8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm3415J3QMS8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm3415J3QMS8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm3415J3QMS8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm3415J3QMS8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm3415J3QMS8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm3415J3QMS8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm3415J3QMS8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm3415J3QMS8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm3415J3QMS8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm3415J3QMS8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm3415J3QMS8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm3415J3QMS8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm3415J3QMS8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm3415J3QMS8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm3415J3QMS8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm3415J3QMS8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm3415J3QMS8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm3415J3QMS8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm3415J3QMS8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm3415J3QMS8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm3415J3QMS8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm3415J3QMS8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Gm3415J3QMS8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm3415J3QMS8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm3415J3QMS8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm3415J3QMS8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm3415J3QMS8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm3415J3QMS8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm3415J3QMS8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm3415J3QMS8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm3415J3QMS8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm3415J3QMS8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm3415J3QMS8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm3415J3QMS8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm3415J3QMS8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm3415J3QMS8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm3415J3QMS8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm3415J3QMS8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm3415J3QMS8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm3415J3QMS8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm3415J3QMS8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm3415J3QMS8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm3415J3QMS8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm3415J3QMS8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm3415J3QMS8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms