Protein–RNA interactions for Protein: J3QJU9

Gm21886, Predicted gene, 21886, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21886J3QJU9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21886J3QJU9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21886J3QJU9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21886J3QJU9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21886J3QJU9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21886J3QJU9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21886J3QJU9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21886J3QJU9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21886J3QJU9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21886J3QJU9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21886J3QJU9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21886J3QJU9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21886J3QJU9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21886J3QJU9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21886J3QJU9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21886J3QJU9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21886J3QJU9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21886J3QJU9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21886J3QJU9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21886J3QJU9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21886J3QJU9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21886J3QJU9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21886J3QJU9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21886J3QJU9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21886J3QJU9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21886J3QJU9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21886J3QJU9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21886J3QJU9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21886J3QJU9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21886J3QJU9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21886J3QJU9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21886J3QJU9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21886J3QJU9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21886J3QJU9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21886J3QJU9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21886J3QJU9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21886J3QJU9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21886J3QJU9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21886J3QJU9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21886J3QJU9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21886J3QJU9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21886J3QJU9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21886J3QJU9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21886J3QJU9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21886J3QJU9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21886J3QJU9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms