Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XntrpcF8VQM8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
XntrpcF8VQM8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XntrpcF8VQM8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XntrpcF8VQM8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XntrpcF8VQM8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
XntrpcF8VQM8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XntrpcF8VQM8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
XntrpcF8VQM8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XntrpcF8VQM8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XntrpcF8VQM8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
XntrpcF8VQM8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XntrpcF8VQM8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XntrpcF8VQM8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XntrpcF8VQM8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
XntrpcF8VQM8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
XntrpcF8VQM8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XntrpcF8VQM8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XntrpcF8VQM8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XntrpcF8VQM8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XntrpcF8VQM8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
XntrpcF8VQM8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XntrpcF8VQM8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XntrpcF8VQM8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XntrpcF8VQM8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XntrpcF8VQM8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XntrpcF8VQM8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XntrpcF8VQM8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
XntrpcF8VQM8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XntrpcF8VQM8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XntrpcF8VQM8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XntrpcF8VQM8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XntrpcF8VQM8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XntrpcF8VQM8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XntrpcF8VQM8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XntrpcF8VQM8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XntrpcF8VQM8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XntrpcF8VQM8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
XntrpcF8VQM8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XntrpcF8VQM8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XntrpcF8VQM8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
XntrpcF8VQM8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XntrpcF8VQM8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XntrpcF8VQM8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XntrpcF8VQM8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XntrpcF8VQM8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XntrpcF8VQM8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XntrpcF8VQM8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
XntrpcF8VQM8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XntrpcF8VQM8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
XntrpcF8VQM8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XntrpcF8VQM8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XntrpcF8VQM8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XntrpcF8VQM8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XntrpcF8VQM8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XntrpcF8VQM8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XntrpcF8VQM8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XntrpcF8VQM8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XntrpcF8VQM8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XntrpcF8VQM8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XntrpcF8VQM8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XntrpcF8VQM8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
XntrpcF8VQM8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XntrpcF8VQM8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
XntrpcF8VQM8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XntrpcF8VQM8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
XntrpcF8VQM8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XntrpcF8VQM8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XntrpcF8VQM8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XntrpcF8VQM8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XntrpcF8VQM8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XntrpcF8VQM8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XntrpcF8VQM8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XntrpcF8VQM8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
XntrpcF8VQM8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XntrpcF8VQM8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
XntrpcF8VQM8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XntrpcF8VQM8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XntrpcF8VQM8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XntrpcF8VQM8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XntrpcF8VQM8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XntrpcF8VQM8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XntrpcF8VQM8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XntrpcF8VQM8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XntrpcF8VQM8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XntrpcF8VQM8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
XntrpcF8VQM8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XntrpcF8VQM8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XntrpcF8VQM8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XntrpcF8VQM8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XntrpcF8VQM8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XntrpcF8VQM8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XntrpcF8VQM8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XntrpcF8VQM8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XntrpcF8VQM8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
XntrpcF8VQM8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XntrpcF8VQM8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XntrpcF8VQM8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XntrpcF8VQM8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
XntrpcF8VQM8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms