Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2564F6Z9S8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2564F6Z9S8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2564F6Z9S8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm2564F6Z9S8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2564F6Z9S8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm2564F6Z9S8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm2564F6Z9S8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm2564F6Z9S8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2564F6Z9S8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2564F6Z9S8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2564F6Z9S8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2564F6Z9S8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2564F6Z9S8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2564F6Z9S8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2564F6Z9S8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2564F6Z9S8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2564F6Z9S8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2564F6Z9S8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2564F6Z9S8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2564F6Z9S8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2564F6Z9S8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2564F6Z9S8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2564F6Z9S8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm2564F6Z9S8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm2564F6Z9S8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2564F6Z9S8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2564F6Z9S8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm2564F6Z9S8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm2564F6Z9S8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2564F6Z9S8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm2564F6Z9S8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm2564F6Z9S8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm2564F6Z9S8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm2564F6Z9S8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm2564F6Z9S8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm2564F6Z9S8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm2564F6Z9S8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm2564F6Z9S8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm2564F6Z9S8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm2564F6Z9S8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm2564F6Z9S8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm2564F6Z9S8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm2564F6Z9S8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm2564F6Z9S8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm2564F6Z9S8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm2564F6Z9S8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm2564F6Z9S8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm2564F6Z9S8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm2564F6Z9S8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2564F6Z9S8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm2564F6Z9S8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm2564F6Z9S8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm2564F6Z9S8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2564F6Z9S8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2564F6Z9S8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2564F6Z9S8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2564F6Z9S8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2564F6Z9S8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2564F6Z9S8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2564F6Z9S8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm2564F6Z9S8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm2564F6Z9S8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2564F6Z9S8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2564F6Z9S8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2564F6Z9S8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2564F6Z9S8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2564F6Z9S8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2564F6Z9S8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2564F6Z9S8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm2564F6Z9S8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm2564F6Z9S8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm2564F6Z9S8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm2564F6Z9S8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2564F6Z9S8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2564F6Z9S8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2564F6Z9S8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2564F6Z9S8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm2564F6Z9S8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm2564F6Z9S8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2564F6Z9S8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2564F6Z9S8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2564F6Z9S8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2564F6Z9S8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2564F6Z9S8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2564F6Z9S8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2564F6Z9S8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2564F6Z9S8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2564F6Z9S8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2564F6Z9S8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2564F6Z9S8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2564F6Z9S8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2564F6Z9S8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2564F6Z9S8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2564F6Z9S8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2564F6Z9S8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2564F6Z9S8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2564F6Z9S8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2564F6Z9S8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2564F6Z9S8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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