Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3072F6SKY8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3072F6SKY8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3072F6SKY8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3072F6SKY8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3072F6SKY8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3072F6SKY8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3072F6SKY8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3072F6SKY8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3072F6SKY8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3072F6SKY8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3072F6SKY8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3072F6SKY8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3072F6SKY8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3072F6SKY8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3072F6SKY8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3072F6SKY8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3072F6SKY8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3072F6SKY8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3072F6SKY8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3072F6SKY8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3072F6SKY8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3072F6SKY8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3072F6SKY8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3072F6SKY8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3072F6SKY8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3072F6SKY8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3072F6SKY8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3072F6SKY8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3072F6SKY8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3072F6SKY8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3072F6SKY8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3072F6SKY8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3072F6SKY8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3072F6SKY8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3072F6SKY8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3072F6SKY8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3072F6SKY8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3072F6SKY8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3072F6SKY8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3072F6SKY8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3072F6SKY8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3072F6SKY8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3072F6SKY8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3072F6SKY8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3072F6SKY8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3072F6SKY8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3072F6SKY8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3072F6SKY8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3072F6SKY8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3072F6SKY8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3072F6SKY8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3072F6SKY8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3072F6SKY8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3072F6SKY8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3072F6SKY8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3072F6SKY8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3072F6SKY8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3072F6SKY8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3072F6SKY8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3072F6SKY8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3072F6SKY8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3072F6SKY8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3072F6SKY8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3072F6SKY8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3072F6SKY8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3072F6SKY8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3072F6SKY8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3072F6SKY8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3072F6SKY8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3072F6SKY8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3072F6SKY8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3072F6SKY8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3072F6SKY8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3072F6SKY8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3072F6SKY8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3072F6SKY8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3072F6SKY8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3072F6SKY8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3072F6SKY8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3072F6SKY8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3072F6SKY8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3072F6SKY8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3072F6SKY8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms