Protein–RNA interactions for Protein: E9QAE1

Nckap5, NCK-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5E9QAE1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nckap5E9QAE1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nckap5E9QAE1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nckap5E9QAE1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nckap5E9QAE1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nckap5E9QAE1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nckap5E9QAE1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nckap5E9QAE1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nckap5E9QAE1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nckap5E9QAE1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nckap5E9QAE1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nckap5E9QAE1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nckap5E9QAE1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nckap5E9QAE1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nckap5E9QAE1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nckap5E9QAE1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nckap5E9QAE1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nckap5E9QAE1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nckap5E9QAE1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nckap5E9QAE1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nckap5E9QAE1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nckap5E9QAE1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5E9QAE1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5E9QAE1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nckap5E9QAE1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nckap5E9QAE1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nckap5E9QAE1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nckap5E9QAE1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nckap5E9QAE1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nckap5E9QAE1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nckap5E9QAE1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nckap5E9QAE1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nckap5E9QAE1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nckap5E9QAE1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nckap5E9QAE1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nckap5E9QAE1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nckap5E9QAE1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nckap5E9QAE1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nckap5E9QAE1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nckap5E9QAE1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nckap5E9QAE1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nckap5E9QAE1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nckap5E9QAE1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nckap5E9QAE1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nckap5E9QAE1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nckap5E9QAE1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nckap5E9QAE1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nckap5E9QAE1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nckap5E9QAE1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nckap5E9QAE1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nckap5E9QAE1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nckap5E9QAE1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nckap5E9QAE1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nckap5E9QAE1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nckap5E9QAE1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nckap5E9QAE1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nckap5E9QAE1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nckap5E9QAE1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nckap5E9QAE1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nckap5E9QAE1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nckap5E9QAE1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nckap5E9QAE1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nckap5E9QAE1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nckap5E9QAE1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nckap5E9QAE1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap5E9QAE1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap5E9QAE1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nckap5E9QAE1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap5E9QAE1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap5E9QAE1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap5E9QAE1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nckap5E9QAE1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nckap5E9QAE1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nckap5E9QAE1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nckap5E9QAE1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nckap5E9QAE1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nckap5E9QAE1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nckap5E9QAE1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nckap5E9QAE1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nckap5E9QAE1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nckap5E9QAE1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nckap5E9QAE1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nckap5E9QAE1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nckap5E9QAE1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nckap5E9QAE1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap5E9QAE1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap5E9QAE1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nckap5E9QAE1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nckap5E9QAE1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nckap5E9QAE1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nckap5E9QAE1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap5E9QAE1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nckap5E9QAE1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nckap5E9QAE1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nckap5E9QAE1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nckap5E9QAE1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nckap5E9QAE1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nckap5E9QAE1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nckap5E9QAE1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nckap5E9QAE1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms