Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pgbd1E9Q492 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pgbd1E9Q492 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pgbd1E9Q492 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pgbd1E9Q492 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pgbd1E9Q492 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pgbd1E9Q492 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pgbd1E9Q492 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pgbd1E9Q492 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pgbd1E9Q492 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pgbd1E9Q492 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pgbd1E9Q492 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pgbd1E9Q492 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pgbd1E9Q492 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pgbd1E9Q492 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pgbd1E9Q492 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pgbd1E9Q492 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pgbd1E9Q492 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pgbd1E9Q492 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pgbd1E9Q492 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pgbd1E9Q492 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pgbd1E9Q492 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pgbd1E9Q492 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pgbd1E9Q492 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pgbd1E9Q492 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pgbd1E9Q492 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pgbd1E9Q492 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pgbd1E9Q492 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pgbd1E9Q492 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pgbd1E9Q492 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pgbd1E9Q492 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pgbd1E9Q492 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pgbd1E9Q492 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pgbd1E9Q492 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pgbd1E9Q492 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pgbd1E9Q492 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pgbd1E9Q492 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pgbd1E9Q492 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pgbd1E9Q492 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pgbd1E9Q492 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pgbd1E9Q492 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pgbd1E9Q492 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgbd1E9Q492 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgbd1E9Q492 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgbd1E9Q492 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgbd1E9Q492 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pgbd1E9Q492 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgbd1E9Q492 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pgbd1E9Q492 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pgbd1E9Q492 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pgbd1E9Q492 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pgbd1E9Q492 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pgbd1E9Q492 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pgbd1E9Q492 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pgbd1E9Q492 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pgbd1E9Q492 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pgbd1E9Q492 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pgbd1E9Q492 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pgbd1E9Q492 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pgbd1E9Q492 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pgbd1E9Q492 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pgbd1E9Q492 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pgbd1E9Q492 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pgbd1E9Q492 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pgbd1E9Q492 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pgbd1E9Q492 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pgbd1E9Q492 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pgbd1E9Q492 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pgbd1E9Q492 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pgbd1E9Q492 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pgbd1E9Q492 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pgbd1E9Q492 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pgbd1E9Q492 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pgbd1E9Q492 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pgbd1E9Q492 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pgbd1E9Q492 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pgbd1E9Q492 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pgbd1E9Q492 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pgbd1E9Q492 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pgbd1E9Q492 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pgbd1E9Q492 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pgbd1E9Q492 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pgbd1E9Q492 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pgbd1E9Q492 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pgbd1E9Q492 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pgbd1E9Q492 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pgbd1E9Q492 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pgbd1E9Q492 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pgbd1E9Q492 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pgbd1E9Q492 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pgbd1E9Q492 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pgbd1E9Q492 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pgbd1E9Q492 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pgbd1E9Q492 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pgbd1E9Q492 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pgbd1E9Q492 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pgbd1E9Q492 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pgbd1E9Q492 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pgbd1E9Q492 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pgbd1E9Q492 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms