Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ApobE9Q414 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ApobE9Q414 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApobE9Q414 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApobE9Q414 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApobE9Q414 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ApobE9Q414 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApobE9Q414 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ApobE9Q414 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApobE9Q414 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApobE9Q414 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ApobE9Q414 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApobE9Q414 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApobE9Q414 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ApobE9Q414 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApobE9Q414 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApobE9Q414 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ApobE9Q414 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ApobE9Q414 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobE9Q414 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobE9Q414 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobE9Q414 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobE9Q414 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobE9Q414 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobE9Q414 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobE9Q414 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApobE9Q414 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApobE9Q414 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ApobE9Q414 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobE9Q414 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ApobE9Q414 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobE9Q414 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ApobE9Q414 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobE9Q414 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobE9Q414 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ApobE9Q414 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ApobE9Q414 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ApobE9Q414 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ApobE9Q414 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ApobE9Q414 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApobE9Q414 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobE9Q414 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobE9Q414 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApobE9Q414 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobE9Q414 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobE9Q414 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApobE9Q414 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobE9Q414 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobE9Q414 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobE9Q414 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobE9Q414 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ApobE9Q414 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobE9Q414 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobE9Q414 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobE9Q414 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobE9Q414 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApobE9Q414 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ApobE9Q414 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ApobE9Q414 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApobE9Q414 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApobE9Q414 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobE9Q414 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApobE9Q414 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobE9Q414 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobE9Q414 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ApobE9Q414 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobE9Q414 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobE9Q414 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobE9Q414 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobE9Q414 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApobE9Q414 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobE9Q414 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobE9Q414 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobE9Q414 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApobE9Q414 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ApobE9Q414 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApobE9Q414 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApobE9Q414 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApobE9Q414 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApobE9Q414 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApobE9Q414 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApobE9Q414 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApobE9Q414 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApobE9Q414 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms