Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3T6

Prdm14, PR domain zinc finger protein 14, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm14E9Q3T6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm14E9Q3T6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm14E9Q3T6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm14E9Q3T6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm14E9Q3T6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm14E9Q3T6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm14E9Q3T6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm14E9Q3T6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm14E9Q3T6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm14E9Q3T6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm14E9Q3T6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm14E9Q3T6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm14E9Q3T6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm14E9Q3T6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm14E9Q3T6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm14E9Q3T6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm14E9Q3T6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm14E9Q3T6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm14E9Q3T6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm14E9Q3T6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm14E9Q3T6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm14E9Q3T6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm14E9Q3T6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm14E9Q3T6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm14E9Q3T6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm14E9Q3T6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm14E9Q3T6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm14E9Q3T6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm14E9Q3T6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm14E9Q3T6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm14E9Q3T6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm14E9Q3T6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm14E9Q3T6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm14E9Q3T6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm14E9Q3T6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm14E9Q3T6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm14E9Q3T6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm14E9Q3T6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm14E9Q3T6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm14E9Q3T6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm14E9Q3T6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm14E9Q3T6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm14E9Q3T6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm14E9Q3T6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm14E9Q3T6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm14E9Q3T6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm14E9Q3T6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm14E9Q3T6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm14E9Q3T6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm14E9Q3T6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm14E9Q3T6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm14E9Q3T6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm14E9Q3T6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm14E9Q3T6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm14E9Q3T6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm14E9Q3T6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm14E9Q3T6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm14E9Q3T6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm14E9Q3T6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm14E9Q3T6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm14E9Q3T6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm14E9Q3T6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm14E9Q3T6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm14E9Q3T6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm14E9Q3T6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm14E9Q3T6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm14E9Q3T6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm14E9Q3T6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm14E9Q3T6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm14E9Q3T6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm14E9Q3T6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm14E9Q3T6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm14E9Q3T6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm14E9Q3T6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm14E9Q3T6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm14E9Q3T6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm14E9Q3T6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm14E9Q3T6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm14E9Q3T6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm14E9Q3T6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm14E9Q3T6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm14E9Q3T6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm14E9Q3T6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm14E9Q3T6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm14E9Q3T6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm14E9Q3T6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm14E9Q3T6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm14E9Q3T6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm14E9Q3T6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm14E9Q3T6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm14E9Q3T6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm14E9Q3T6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm14E9Q3T6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm14E9Q3T6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm14E9Q3T6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm14E9Q3T6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm14E9Q3T6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm14E9Q3T6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm14E9Q3T6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm14E9Q3T6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms